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Los insectos son un componente clave en los ecosistemas de agua dulce. Son estructuralmente importantes por su aporte a la densidad, biomasa y riqueza taxonómica de las comunidades de invertebrados. Además están involucrados en números procesos ecológicos fundamentalmente tróficos, reciclando materia y nutrientes. En última instancia, conectan la base de las tramas tróficas con los niveles superiores representados mayormente por vertebrados acuáticos y terrestres. A pesar de las implicancias ecológicas, el estudio de los hábitos tróficos en nuestro país es escaso y limita la comprensión de la estructura y función que cumplen los insectos acuáticos en estos ecosistemas. Su clasificación trófica en grupos funcionales alimentarios (GFA) a pesar de presentar ciertas limitaciones metodológicas y conceptuales sigue siendo una herramienta valiosa para interpretar su papel en la transferencia de materia y energía. En una reciente revisión de los GFAs a nivel de familia para Latinoamérica, 73% de las 142 familias distribuidas en el Neotrópico fueron asignadas a GFAs basándose en estudios realizados en el Neártico y Australasia. Esto muestra que es fundamental sistematizar la identificación de los hábitos alimentarios de las especies de insectos acuáticos de nuestra región a fin de asociar recursos y consumidores en un ambiente dado. Discutiremos aspectos metodológicos elementales para abordar estudios de hábitos alimentarios (diseño de muestreo, dieta, aparato bucal, experimentación, análisis de datos) y conceptuales de la temática, sus limitaciones y sus alcances. Este conocimiento permitirá avanzar en una ciencia cuantitativa en relación con los cambios asociados a la alteración en la disponibilidad de recursos tróficos como consecuencia de las actividades humanas en los ecosistemas acuáticos como las que ocurren en los ecosistemas terrestres circundantes.