INIBIOMA   20415
INSTITUTO DE INVESTIGACIONES EN BIODIVERSIDAD Y MEDIOAMBIENTE
Unidad Ejecutora - UE
congresos y reuniones científicas
Título:
OBTENCIÓN, ENSAMBLE Y ANÁLISIS DE GENOMAS DE LEVADURAS NATIVAS DE INTERÉS BIOTECNOLÓGICO
Autor/es:
NICOLAS BELLORA
Lugar:
Bariloche
Reunión:
Congreso; XLIII CONGRESO ARGENTINO DE GENÉTICA; 2014
Institución organizadora:
Sociedad Argentina de Genética
Resumen:
OBTENCIÓN, ENSAMBLE Y ANÁLISIS DE GENOMAS DE LEVADURAS NATIVAS DE INTERÉS BIOTECNOLÓGICOBellora, Nicolás. Instituto de Investigaciones en Biodiversidad y Medioambiente (CONICET-UN Comahue), Bariloche, Argentina. e-mail: nbellora@gmail.comLa síntesis de micosporinas (MIC) en Phaffia rhodozyma ha abierto un amplio espectro de interrogantes de carácter bioquímico, ecológico, taxonómico y biotecnológico que requieren ser respondidos. El genoma completo será utilizado como base para resolver aspectos básicos como su inducción y regulación. Hemos obtenido los borradores genómicos mediante el ensamblaje de paired-end secuenciados con Illumina de las cepas CBS7918T (N50=75,9K) y CRUB1149 (N50=163,6K), de aproximadamente 19Mb, un contenido de G+C del 47% y 2,4% de regiones repetitivas. Los errores de secuenciación estuvieron debajo del 0,1% y el 98% de las secuencias de P. rhodozyma en NCBI y secuencias de provenientes de estudios de RNA-seq fueron cubiertas. Se identificaron los reads y ensamblaron los clusters completos de rRNA nucleares, los genomas mitocondriales y plásmido pDK1, cada ensamblaje con un coverage proporcional a la cantidad de copias por célula. El análisis comparativo entre cepas muestra un 3-4% de divergencia en secuencias genómicas y 92% de genes comunes. Realizamos estudiosfilogenómicos a partir de genes comunes a todos los organismos eucariotas (CEG). Localizamos los genes de síntesis de astaxantina, se predijeron nuevas enzimas reguladoras y se encontró el cluster de genes responsable de la síntesis de MIC, hasta ahora desconocido.