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Los líquenes (hongos liquenizados) son una asociación simbiótica entre un hongo (micobionte) y un alga verde y/o cianobacteria (fotobionte). Numerosos líquenes poseen como fotobionte a cianobacterias del género Nostoc, aunque también se han mencionado otros géneros como Calothrix, Gleopcapsa, y Stigonema. La diversidad y especificidad de los cianobiontes en líquenes ha sido poco estudiada a nivel mundial y de Patagonia solo existen estudios para la región insular de Tierra del Fuego. El objetivo de este trabajo es estudiar la diversidad de los fotobiontes de Pseudocyphellaria hirsuta (Mont.) Malme y determinar las relaciones evolutivas de los linajes encontrados con otros linajes de Nostoc. Esta especie de liquen, endémica de la subregión Subantártica, crece principalmente sobre corteza de árboles y arbustos tolerando un amplio rango de condiciones ecológicas, su fotobionte primario es Nostoc y su morfología y química son variables. Se extrajo ADN del talo liquénico y se secuenció la región trnL del cloroplasto con cebadores específicos para cianobacterias. De la base de datos GenBank se obtuvieron todas las secuencias existentes de esta región para cianobiontes ya sea de líquenes o de otros organismos tales como antoceros, hepáticas y musgos. Estas secuencias se utilizaron para un análisis filogenético. Los datos preliminares muestran que los linajes del simbionte Nostoc de P. hirsuta se encuentran en el mismo clado con otras cepas de Nostoc encontradas en otras especies de Pseudocyphellaria y otros líquenes de los géneros Lobaria, Nephroma, Pannaria, Parmeliella y Sticta. Las cepas de Nostoc en simbiosis con P. hirsuta de la Patagonia norte no se agrupan con otras cepas de esta especie de Tierra del Fuego ni con las de otras especies de Pseudocyphellaria presentes en Patagonia.