Diagnóstico Molecular de Encefalomiopatías Mitocondriales: Evaluación de una Plataforma de Pirosecuenciación Masiva

KAUFFMAN MARCELO; GONZALEZ MORON DOLORES; CONSALVO DAMIAN; WESTERGAARD G; VAZQUEZ M; MANCINI E; TARATUTO A; REY R; KOCHEN SILVIA

Buenos Aires

Congreso; 41 Reunión Anual Sociedad Argentina de Investigación Clínica; 2011

SOCIEDAD NEUROLOGICA ARGENTINA

Introducción y Objetivos: Los trastornos mitocondriales son un grupo frecuente de trastornos neurogenéticos de difícil diagnóstico en la práctica asistencial en el que los avances de la genética han impactado su caracterización, clasificación y diagnóstico. Estos avances incluyen nuevas metodologías de secuenciación genómica que permiten obtener vastos volúmenes de información a un menor costo. Nuestro objetivo fue evaluar la utilidad de una plataforma genómica en el diagnóstico molecular de las Encefalomiopatías mitocondriales (EM). Materiales y Métodos: Se analizó la secuencia completa del genoma mitocondrial (ADNmt) de 2 pacientes con EM mediante la utilización de Long range PCR y pirosecuenciación masiva en sistema GS-FLX 454. Procesamiento bioinformático que incluyó herramientas gsMapper, Tablet, SIFT, MITOMAP y PHYLOTREE. Resultados: Se obtuvieron 227.469 fragmentos de aproximadamente 330 bases cada uno, equivalentes a 75.000.000 de nucleótidos, que permitieron identificar 2 mutaciones patogénicas diagnósticas en el ADNmt: 3243A>G y 8344A>G. Se reconocieron 9 variantes heteroplásmicas fisiológicas en ambos ADNmt. Se identificaron 74 polimorfismos que permitieron caracterizar los haplogrupos a alta resolución de ambos ADNmt. Se validaron técnicamente los hallazgos mediante secuenciación por electroforesis capilar. Conclusiones: A través del presente estudio pudimos mostrar la utilidad cierta de esta plataforma genómica en el diagnóstico preciso de los trastornos mitocondriales y vislumbrar la posibilidad de un diagnóstico molecular y exhaustivo de la patología neurogenética en nuestro país con recursos humanos y tecnológicos locales.