INVESTIGADORES
VAZQUEZ Elba Susana
congresos y reuniones científicas
Título:
ANÁLISIS BIOINFORMÁTICO DEL INTERACTOMA DE HEMO-OXIGENASA 1 (HO-1) EN CÁNCER DE PRÓSTATA
Autor/es:
ORTIZ EMILIANO GERMAN; PAEZ ALEJANDRA; GIUDICE JIMENA; VALACCO PIA; COTIGNOLA JAVIER; MARTI MARCELO; ELBA VAZQUEZ; GUERON GERALDINE
Lugar:
Mar del Plara
Reunión:
Congreso; SAIC 2014 Reunion Anual; 2014
Institución organizadora:
SAIC
Resumen:
El cáncer de próstata (PCa) es la segunda causa de muerte por esta enfermedad en los hombres occidentales. La integración de la proteómica junto con las nuevas herramientas bioinformáticas proveen de resultados promisorios que pueden trasladarse a la clínica del PCa. Con estos abordajes experimentales nuestro objetivo fue identificar a los interactores de HO-1, enzima responsable del mantenimiento de la homeostasis celular. Para identificar las proteínas que interactúan con HO-1 se realizó un GST-pull down. HO-1 fue subclonada en un vector de expresión eucariota (pEBG) fusionado por su extremo amino terminal a un tag de GST para permitir la purificación por columna de afinidad. Con esta construcción, transfectamos la línea celular PC3. Para el análisis por MALDI-TOF/TOF, los péptidos fueron desalados y concentrados con una resina C18 y analizados utilizando el software Flex Analysis and Biotools. Las búsquedas fueron realizadas contra el genoma humano, permitiendo una tolerancia de 200ppm y una tolerancia de fragmento de 0,7 Da. Se contemplaron las alteraciones de masa producidas por las modificaciones esperadas como la carbamidometilación, la oxidación de metionina y la acetilación N-terminal. Solo proteínas diferenciales unidas a GSTHO-1 fueron consideras para su posterior análisis. Se obtuvieron 46 proteínas diferenciales, interactoras de HO-1, definiendo así el interactoma de HO-1 preliminar. Para este set de proteínas realizamos un análisis de red de interacciones y un análisis de ontología génica. Los resultados revelaron un enriquecimiento de proteínas asociadas a varias subcategorías relacionadas con componentes celulares, funciones moleculares y procesos biológicos. La detección de proteínas nucleares asociadas a HO-1 sugieren que el interactoma de HO-1 funciona como una maquinaria tanscripcional y de procesamiento del RNA responsable de la modulación de los genes efectores de HO-1.