Caracterización de transcriptos no codificantes asociados a la expresión de la apomixis en Paspalum notatum

OCHOGAVIA A; SEIJO G; GONZÁLEZ AM; CERVIGNI G; PODIO M; LASPINA N; DUARTE SILVEIRA ERICA; MACHADO LACERDA AL; CAMPOS CARNEIRO V; PESSINO SC

Rosario

Simposio; VII Simposio Nacional de Biotecnología REDBIO Argentina; 2009

REDBIO Argentina

La apomixis es una forma de reproducción clonal vía semillas. La caracterización de sus bases moleculares podría facilitar su uso controlado en la agricultura con enormes beneficios potenciales. En trabajos anteriores nuestro grupo identificó 65 transcriptos diferencialmente expresados en inflorescencias de plantas apomícticas y sexuales de Paspalum notatum. De ellos, 45 correspondieron a secuencias génicas mayoritariamente agrupadas en unas pocas clases ontológicas, pero 20 no fueron anotadas funcionalmente por no mostrar homologías significativas en las bases de datos. El objetivo de este trabajo fue asignarles un identidad funcional probable a estos últimos transcriptos. Para 4 candidatos se diseñaron cebadores que amplificaron fragmentos del peso molecular esperado a partir del genoma y del transcriptoma. Las hibridaciones in situ de tejidos reproductivos confirmaron su expresión diferencial. Se obtuvieron secuencias extendidas por 5´ y 3´ RACE (Rapid Amplification of cDNA Ends). Ninguno de los transcriptos mostró marcos de lectura abiertos (ORFs). aunque sí se observaron homologías completas con genes conocidos en sectores muy pequeños (25-400 nt). Búsquedas informáticas más amplias indicaron que dos de las secuencias extendidas son homólogas a pre-miRNAs. Se predijeron sus estructuras plegadas utilizando el programa MFold. Las otras dos secuencias resultaron similares a retrotransposonesde gramíneas que llevan segmentos de genes regulados diferencialmente durante el desarrollo apomíctico (serk, cytP450). Un relevamiento del resto de las secuencias desconocidas demostró homologías con premiRNAs o retrotransposones portadores de segmentos génicos conservados cortos. Estos resultados sugieren un posible papel regulatorio para los transcriptos bajo estudio.