ANÁLISIS COMPARATIVO DE DIFERENTES PROTOCOLOS PARA LA EXTRACCIÓN DE ADN DE HONGOS.

NAHUEL POLICELLI; AILIN O´DONOHE; ISABEL E. CINTO; MARCELA GALLY; ARACELI M. RAMOS

La Plata

Congreso; 34 Jornadas Argentinas de Botánica; 2013

Sociedad Argentina de Botánica

La extracción de ADN es un paso decisivo antes de la PCR. La presencia de ciertos metabolitos puede interferir con los métodos de extracción y con la posterior restricción y amplificación. La heterogeneidad entre las especies fúngicas puede requerir diferentes protocolos. El ADN contaminado con polisacáridos y compuestos fenólicos no responde bien a la digestión con enzimas de restricción y a la amplificación por PCR. En este trabajo, se compararon el rendimiento y la calidad del ADN obtenido con tres protocolos de extracción: el de Gottlieb et al., (2001), que se utiliza de forma rutinaria en nuestro laboratorio, una modificación de los protocolos de Al-Samarrai y Schmid (1993), y de Kuhad et al. (2004) ambos métodos desarrollados para la extracción de ADN de hongos que producen polisacáridos y el kit comercial ZR PLANT DNA. Hemos encontrado que la extracción de ADN a partir de Macrophomina phaseolina y Colletotrichum graminicola por el método de Gottlieb dio muy bajo rendimiento y calidad de ADN. De los otros métodos testeados: el Kit produjo alta calidad pero muy bajo rendimiento, el método de Al-Samarrai buen rendimiento, pero baja calidad y el de Kuhad buen rendimiento y calidad del ADN extraído constituyendo un buen método de extracción para estas especies fúngicas.