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Mycocitrus Möller corresponde a um gênero tropical que contém duas espécies que formam grandes estromas em colmos de bambu. Durante um levantamento de macrofungos no estado de Santa Catarina foram coletados quatro espécimes de Mycocitrus aurantium Möller, uma espécie considerada rara por ter sido pouco citada na literatura. Os objetivos desse trabalho foram contribuir para o conhecimento sobre a morfologia da espécie, comunicar pela primeira vez a obtenção de cultura da espécie e discutir seu posicionamento filogenético com base em dados moleculares. Estudos morfológicos e filogenéticos foram conduzidos a partir de espécimes frescos e culturas. A filogenia apresentada foi construída com base na sequência do espaçador interno transcrito do DNA ribossomal (ITS). Atualmente, o gênero Mycocitrus é aceito na família Bionectriaceae (Hypocreales); entretanto, este posicionamento não se sustenta quando apenas os caracteres morfológicos são levados em consideração.