Estructura genética de las comunidades bacterianas en el agua y sedimentos de un ecosistema lótico contaminado.

MERLO, CAROLINA; ABRIL, ADRIANA; AMÉ, MARÍA VALERIA

Buenos Aires

Congreso; II Congreso de Microbiología Agrícola y Ambiental.; 2013

Asociación Argentina de Microbiología

El Río Suquía (Córdoba, Argentina) es un ecosistema lótico, de corto recorrido, escaso caudal estacional y de cuenca endorreica que soporta una elevada presión antrópica. Dichas características definen y modifican la composición química del agua y el tipo de sedimentos, lo cual incide en gran medida sobre la dinámica microbiana. En la actualidad se utilizan técnicas biomoleculares para analizar la estructura genética de las comunidades microbianas permitiendo un análisis comparativo de diferentes situaciones. El objetivo de este trabajo fue analizar la estructura genética de la comunidad bacteriana en agua y sedimentos del Río Suquía con la finalidad de establecer el efecto de la contaminación provocado por la ciudad de Córdoba sobre la diversidad microbiana. Se seleccionaron 6 sitios de estudio a lo largo de aproximadamente 100 km en el Río Suquía: un sitio ubicado 18 km aguas arriba de la ciudad, 3 sitios dentro de la ciudad (entrada, centro y salida del río de la ciudad), un sitio 12 km aguas abajo de la planta de tratamiento de líquidos cloacales de Córdoba y un sitio 50 km aguas abajo de la ciudad. En cada sitio se tomaron muestras compuestas de agua y sedimentos (n=5), en las épocas de bajo y alto caudal de agua del río. A partir de las muestras de agua y sedimentos se extrajo el metagenoma ambiental y se analizó la estructura genética bacteriana mediante PCR-RFLP (reacción en cadena de la polimerasa-polimorfismo de fragmentos largos de restricción) del gen 16S ARNr. La riqueza bacteriana se determinó por el número de bandas y la similitud entre comunidades mediante el Coeficiente de Jaccard. La riqueza varió significativamente siendo mayor en agua (8,75, rango 5-13) que en sedimentos (5,27, rango 3-7), mientras que en el agua se detectaron 8 bandas exclusivas y en sedimentos solo una. La comunidad bacteriana del agua fue diferente a las comunidades de los sedimentos detectándose una baja similitud genética entre las comunidades analizadas en agua, lo cual indica que la estructura genética bacteriana es afectada por el sitio y la época de muestreo. La elevada riqueza detectada en el agua refleja una mayor diversidad de especies bacterianas, lo cual está sustentado por la mayor cantidad de bandas exclusivas que se obtuvieron de muestras provenientes de agua. Probablemente esta mayor riqueza se deba a que el río en todo su recorrido recibe constantemente efluentes de diferentes fuentes y detritos de la vegetación circundante. Además, aunque las comunidades en el agua tienen una baja similitud genética a lo largo del río, no se observa una disminución en el número de bandas lo que indica un importante proceso de reemplazo de especies. Contrariamente, en los sedimentos, podrían establecerse comunidades microbianas más estables en las que sólo algunas especies serían dominantes. Se concluye que la contaminación antrópica provoca cambios en las comunidades bacterianas del Río Suquía, particularmente en las que habitan en el agua.