Influencia de polimorfismos genéticos cortos sobre la regulación de la expresión génica mediada por cuádruplex de guanina.

ARMAS, P.; PIGA, E.J.

Buenos Aires

Workshop; Workshop de Biología Celular y Molecular del ARN; 2018

CLUB DE RNA DE BUENOS AIRES

Los cuádruplex de Guanina (G-quadruplex o G4) son estructuras de ácidos nucleicos no canónicas formadas por el apilamiento de al menos dos tétradas de guanina unidas por enlaces de hidrógeno Hoogsteen. Los G4 intramoleculares pueden formarse transitoriamente en regiones regulatorias del ADN ricas en G durante la transcripción y la replicación, o en regiones regulatorias ricas en G de los ARNm. Se han informado genes relacionados con enfermedades humanas (mayormente proto-oncogenes) regulados transcripcionalmente por G4 de ADN formados en sus regiones promotoras proximales, mientras que otros pueden regularse traduccionalmente por G4 de ARN formados en regiones regulatorias los ARNm (principalmente 5? UTR). Las secuencias capaces de formar G4 (PQS) están definidas por el consenso G2-5N1-7G2-5N1-7G2-5N1-7G2-5. Variaciones sutiles en las PQS pueden alterar la estabilidad y/o topología de los G4, con posibles efectos sobre el control de la expresión génica. En este trabajo desarrollamos estrategias in silico para encontrar variaciones de secuencia cortas de origen natural (SSV, incluidos polimorfismos de nucleótido único y deleciones e inserciones cortas) en PQS presentes en regiones reguladoras de la transcripción o traducción de genes relacionados con enfermedades humanas. Además, presentamos resultados y estrategias experimentales preliminares de ensayos in vitro e in cellulo para analizar los efectos de las SSV en la formación de G4 y en el control de la expresión génica.