Estudio Computacional de la Interacción Proteína-ARNdh en Plantas

MORENO, DIEGO M.; RASIA, RODOLFO M.; DRUSIN, SALVADOR I.

Encarnación

Congreso; XXV jornadas de Jóvenes Investigadores de AUGM; 2017

Asociación de Universidades del Grupo Montevideo

p { margin-bottom: 0.25cm; direction: ltr; color: rgb(0, 0, 0); line-height: 120%; }p.western { font-family: "Calibri",sans-serif; font-size: 11pt; }p.cjk { font-family: "Calibri",sans-serif; font-size: 11pt; }p.ctl { font-family: "Times New Roman",serif; font-size: 11pt; }a:link { }Los micro-ARNs (miARNs) son una clase deARNs pequeños que actúan como reguladores de la expresióngenética. Los miARNs tienen un importante rol en la regulación deldesarrollo y la fisiología de las plantas, participando en elcrecimiento, señales hormonales, y respuestas a estrés de lasmismas. Estos miARNs son procesados a partir del precursor(pri-miARN) por la enzima Dicer-like 1 (DCL1) con la participaciónde otras proteínas. DCL1 reconoce el precursor, y se posiciona enuna locación específica, realizando cortes en el mismo y liberandoel miARN producto. Este reconocimiento es particularmente complejo,dada la heterogeneidad de tamaño y estructura de los precursores,cuya única característica común es su forma de hebilla.Empleamos técnicas de dinámicamolecular (DM), en las cuales se modelan matemáticamente todas lasinteracciones entre los átomos del sistema y se simula a través deun tiempo determinado. Esto permite visualizar las posiciones de cadaátomo a través del tiempo, algo que sería imposible mediante otrastécnicas.En este trabajo estudiamos elreconocimiento del pri-miARN por el dominio de unión a ARN de doblehebra (dsRBD) de DCL1 (dominio DCL1-1) de Arabidopsisthaliana. Se cree que estedominio puede tener un rol importante en el reconocimiento delsustrato y el posicionamiento de la proteína.Durante la DM se pudo observar un cambioconformacional en el cual se produce una curvatura axial en elpri-miARN. Además se pudo identificar cuáles de los aminoácidos deDCL1-1 son los responsables de la interacción con el sustrato.Dentro de éstos, encontramos que Arg8, tiene un rol importante en elreconocimiento de la secuencia del pri-miARN.