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Las referencias de restos fósiles de la Puna son escasas; las más diversasy abundantes incluyen mayormente fauna paleozoica constituida principalmente por trilobites, graptolites, conodontes, trazas y en menor medida se registran foraminíferos, braquiópodos, esponjas, moluscos, briozoos y cnidarios. Los datos florísticos paleozoicos son también escasos y no están analizados en detalle, a excepción de criptoesporas ordovícico-silúricas. Las rocas sedimentarias mesozoicas expuestas en la región están virtualmente desprovistas de elementos bióticos asociados. Escasos restos de cianobacterias, foraminíferos, ostrácodos,equinodermos, moluscos y peces fueron citados para depósitos jurásicos y cretácicos. El contenido paleontológico cenozoico incluye principalmente vertebrados del Eoceno tardío cuyo grupo más significativo y mejor conocido lo constituyen los mamíferos. Entre estos, los más diversos son los Metatheria y los euterios Notoungulata y Cingulata que en algunos casos indican un regionalismo marcado en relación a la fauna coetánea de unidades eocenas próximas, mientras que en otros evidencian una asociación de fauna relacionada a diversos taxones de distribución temporal y geográfica más amplia. Son también llamativas las huellas de aves mi ocenas y pleistocenas y los restos óseos de fauna pliocena y pleistocena. En el contexto regional, la Puna limita con provincias morfotectónicas muy ricas en contenido fósil; en este marco, la intensificación y sistematización de las prospecciones paleontológicas y elestudio detallado del material ya recuperado proveerá evidencia relevante para comprender o reinterpretar diversos aspectos de la evolución de parte de la biota sudamericana en estas latitudes.