Evaluación in silico de compuestos polifenólicos como posibles inhibidores de la arginina quinasa de Trypanosoma cruzi

VALERA VERA EA; MIRANDA MR; REIGADA C; SAYE M; PEREIRA CA

Simposio; XVII Simposio Internacional sobre enfermedades desatendidas. Fundación Mundo Sano; 2015

IntroducciónLa arginina quinasa (AK) es una enzima de gran importancia en el equilibrio energético de Trypanosoma cruzi, así como en la resistencia a distintos tipos deestrés. Por su ausencia en el hospedador mamífero, la AK es un buen blanco quimioterapéutico. Se han reportado pocos inhibidores de esta enzima, todos ellospertenecientes al grupo de los polifenoles. Por esta razón se decidió probar modelos in silico de la unión de representantes de varios grupos de polifenoles alsitio activo de la AK.Materiales y métodosDe la base de datos de compuestos disponibles comercialmente, ZINC, se obtuvieron las estructuras 3D de los ligandos probados. A estas estructuras se les minimizó la energía en el servidor PRODRD2. La estructura cristalina de la AK de T. cruzi se obtuvo de la base de datos de proteínas de RCSB y se completaron los residuosfaltantes con la AK de Limulus poliphemus. Usandoel programa AutoDock Tools se ensayaron los diferentes ligandos, fijandose como flexibles los residuos de la AKSer63, Gly64, Ile65, Tyr68, His315, Glu225,Glu314, Cys271, que han sido reportados como importantes en la unión o catálisis de la arginina. Los grupos con menor energía de se tomaron como formasrepresentativas de la unión de los ligandos. Se compararon las energías libres de unión mínimas de cada complejo enzima-ligando usando como controlpositivo el modelado del complejo AK-arginina.Resultados y discusiónDe los ligandos probados 6 tuvieron una energía libre menor a la del control con arginina (-8,11), de los cuales la menor energía fue la calculada para el compuesto rutina (-13,89). La parte fenólica de la rutina se localizó en el bolsillohidrofóbico del sitio activo, mientras que el disacárido estaría interactuando con residuos polares, resultando en una mayor afinidad por la enzima en comparación a los otros polifenoles probados, los cuales no están glicosilados. Mediante esta estrategia se elegirán los compuestos para realizar ensayos in vitro de inhibición de la AK recombinante y nativa, evaluando posteriormentesu acción tripanocida en cultivo.