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El diseño de materiales con propiedades físicas seleccionadas requiere un entendimiento profundo de los fragmentos moleculares, su organización e interconexión. En este contexto, los polímeros de coordinación líquido cristalinos, en particular los tetracarboxilatos de Ru de valencia mixta, conforman una clase de materiales que se espera presenten las propiedades correspondientes tanto a los polímeros de coordinación como a los cristales líquidos (CL) que contienen metales.La conformación del polímero es determinante a la hora de estudiar las propiedades físicas del compuesto. Dada la dificultad experimental intrínseca de estudiar la estructura de la fase CL, decidimos encarar una simulación atomística que nos permita analizar en detalle los distintos factores que afectan la organización en la mesofase.Las simulaciones se realizaron con el paquete AMBER. Dado que el mismo está desarrollado principalmente para la simulación de sistemas biológicos, utilizamos cálculos cuánticos previos sobre nuestros sistemas para estimar los parámetros faltantes y desarrollar un campo de fuerzas apropiado.Se validó este campo de fuerzas comparando los resultados con datos experimentales y datos cuánticos en sistemas modelo con resultados muy satisfactorios. Estudios de mecánica y dinámica molecular en sistemas complejos que forman fase CL, permitieron entender con mayor profundidad los factores que determinan la conformación del polímero y correlacionan adecuadamente con resultados experimentales previos.