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La familia Orchidaceae se encuentra estrechamente relacionada con hongos micorrícicos pertenecientes al género Rhizoctonia. Esta asociación es esencial para el desarrollo de nuevas plantas ya que favorecen el proceso de germinación de las semillas. Por esta razón, los cambios ambientales que influyen en la distribución de estos hongos también afectan a las poblaciones de orquídeas. Es por esto, que el conocimiento de la naturaleza de esta interacción es importante para que los resultados de los programas de conservación sean efectivos. En este trabajo se caracterizaron las cepas de endosimbiontes asociadas a orquídeas terrestres nativas recolectadas en el Valle de Punilla (Córdoba). Con este fin se aislaron y caracterizaron los hongos presentes en las raíces, obteniéndose 23 aislamientos en total. Se estudiaron las características morfológicas de las colonias y se observó el número de núcleos por célula con tinción con Safranina. Se enfrentaron aislamientos in vitro para establecer grupos de anastomosis y éstos con los patrones AG-A, AG-Bo, AG-6 y AG-12 citados para orquídeas terrestres. Se estudiaron las secuencias de la región ITS rDNA y se compararon con secuencias del género Rhizoctonia aisladas de orquídeas depositadas en el GenBank, con el fin de establecer las relaciones filogenéticas existentes entre ellos y con las especies conocidas. Se obtuvieron 10 subgrupos, de los cuales 5 presentaron células binucleadas y 5 multinucleadas. Ninguno de los aislamientos mostró pertenecer a alguno de los patrones conocidos para orquídeas terrestres. Finalmente, este estudio evidenció una gran variabilidad respecto al grado de especificidad en la simbiosis que se establece entre las raíces de estas orquídeas terrestres y los aislamientos obtenidos a partir de ellas. Mientras que algunas especies de orquídeas sólo establecen asociaciones con un subgrupo, otras pueden ser colonizadas por más de uno.