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Las bacterias pertenecientes al género Burkholderia poseen una gran versatilidad metabólica y son capaces de sintetizar combinaciones únicas de moléculas bioactivas cepa-dependientes, algunas de las cuales presentan un alto potencial biotecnológico para su aplicación como biopesticidas. Nuestro laboratorio cuenta con las cepas nativas B. ambifaria BNM299 y B. pyrrocinia BNM345, aisladas a partir de la rizósfera de plantas de soja, y la cepa BNM349, aislada a partir de bulbos de gladiolo con síntomas de pudrición e identificada como B. gladioli pv. gladioli. La actividad antimicrobiana de estas cepas se evaluó in vitro por difusión en agar utilizando células vivas, sobrenadantes libres de células y extractos de membrana contra distintos microorganismos fitopatógenos. Si bien las tres cepas de Burkholderia mostraron actividad antimicrobiana, las fracciones extracelular y de membrana mostraron una capacidad inhibitoria diferencial. Mientras que la actividad antibacteriana contra las especies fitopatógenas Xanthomonas campestris pv. campestris y Clavibacter michiganensis subsp michiganensis fue mayor en los sobrenadantes libres de células de B. gladioli BNM349, la actividad antifúngica contra Macrophomina phaseolina se observó mayormente en las membranas celulares de B. ambifaria BNM299 y B. pyrrocinia BNM345. Además, la fracción de membrana de la cepa BNM299 presentó una notable inhibición del crecimiento de Fusarium graminearum. Resultados preliminares en relación a la caracterización estructural por MALDI-TOF MS de los metabolitos bioactivos muestran una gran diversidad de masas moleculares en el rango de 700 a 3300 Da. Se propone avanzar en establecer las condiciones de producción óptimas y caracterización de los compuestos producidos por cepas del género Burkholderia con el fin de utilizarlos para el control biológico de enfermedades que afectan a cultivos de valor económico de la región.