Estructura de Solvatación del Sitio de Reconocimiento de Carbohidratos: Rol de las moléculas de agua en la predicción de la interacción de CD44 con diferentes oligosacáridos.

MODENUTTI, CARLOS; GAUTO D; HAJOS SILVIA E.; MARTI M

Córdoba

Congreso; Reunión Anual de SAB; 2011

SAB

El Ácido Hialurónico (AH) es un Glicosaminoglicano que se encuentra en la matriz que rodea a células en proliferación o migración y se expresa en altos niveles en una variedad de tumores. CD44, una glicoproteína con función lectína presente en la superficie celular, es el principal receptor para AH. Los oligosacáridos de AH (oAH) son capaces de desplazar la interacción CD44-AH bloqueando así los estímulos de sobrevida y la capacidad migratoria de células tumorales. Así también, se sabe que otros oligosacáridos pueden unirse al CRD de CD44, pero las bases de dichas interacciones  no están del todo claras1. El sitio de reconocimiento de carbohidratos (CRD) de las lectínas puede ser descripto a partir del análisis de la estructura del solvente, caracterizada por la presencia de sitios de hidratación (WS, del inglés water-sites) que se forman sobre la superficie2. La interacción entre los residuos del CRD y las moléculas de agua que albergan los WS se asemeja a la interacción entre los grupos -OH de los azucares con aminoácidos del receptor3. En trabajos previos del laboratorio, demostramos la capacidad de los WS para predecir la posición de átomos polares del ligando (EWS) para el complejo CD44-oAH. La hipótesis de trabajo fue que a mayor número de EWS para un oligosacárido, más estables serán los complejos con CD44. El objetivo del trabajo fue determinar la capacidad de los EWS para predecir la estabilidad energética de diferentes complejos. Para ello, realizamos simulaciones de Dinámica Molecular con solvente explicito durante 50ns para CD44 y diferentes oligosacáridos (oAH, Lichenin (oLI), Quitosano (oQO) y Quitina (oQI)). Calculamos las energías de unión mediante MM-GB (SA) y los EWS para cada caso. Los valores de energía para los complejos CD44-oAH, oLI, oQO y oQI fueron de -24,82; -11,31 -34,97 y -12,04 Kcal/mol respectivamente. El número de EWS fue de 5; 2; 8 y 2 para oAH, oLI, oQO y oQI respectivamente. Concluimos que el número de EWS es un buen parámetro para predecir la estabilidad relativa de diferentes complejos CD44-oligosacaridos.