IDEHU   05542
INSTITUTO DE ESTUDIOS DE LA INMUNIDAD HUMORAL PROF. RICARDO A. MARGNI
Unidad Ejecutora - UE
congresos y reuniones científicas
Título:
Estructura de Solvatación del Dominio de Reconocimiento de Carbohidratos de CD44: Introducción Mejorando la búsqueda In Sílico de Fármacos Glicomiméticos.
Autor/es:
MODENUTTI, C; GAUTO, D; HAJOS, S; MARTI, M
Lugar:
Cordoba
Reunión:
Congreso; 2do Congreso Argentino de Bioinformática y Biología Computacional; 2011
Institución organizadora:
Asociacion Argentina de Bioinformatica y Biologia Computacional
Resumen:
El Ácido Hialurónico (AH), un Glicosaminglicano lineal compuesto por unidades repetidas de N-Acetil-D-glucosamina (Glc-NAc) y Acido D-Glucuronico (Glc-A), es un componente importante del microambiente en la mayoría de los tumores malignos. Numerosas evidencias experimentales en modelos animales demuestran una correlación entre el AH en el crecimiento tumoral y la metástasis. CD44 es el principal receptor para el AH, y la interacción CD44-AH parece desempeñar un rol crucial tanto en la malignidad de los tumores como en la resistencia a quimioterapicos. En trabajos anteriores la combinación de Dinámica Molecular (DM) con análisis estadístico, demostró que las propiedades de la las moléculas de agua cerca de la superficie de los dominios de reconocimiento de carbohidratos (CRD) de diferentes lectinas, se parecen a la estructura de los complejos lectina carbohidrato. En concreto, hemos definido a estas regiones como Sitios de Agua (WS) y DL-WS a regiones del espacio cerca de la superficie de la proteína con la máxima probabilidad de ser cupados por átomos polares del ligando. La metodología de WS nos permitió calcular los clusters de aguas que se forman en ausencia del ligando y en presencia del mismo. Demostramos que cuando el ligando esta presente, numerosos WSs son desplazados en el CDR muy probablemente debido a que se establecen interacciones entre los residuos generadores de los WSs y el ligando.Pudimos establecer que para el sistema CD44-AH, los WSs son útiles para predecir de que manera se puede establecer la interacción. Esta afirmación esta respaldada por cálculos de Docking , los cuales resultaron ser mas precisos cuando sele suministro la información de los WSs. Es por ello que,inferencias formuladas a partir de los WSs tiene grandes chances de ser correctas. De esta manera, la metodología nos permitiría sugerir sutiles modificaciones químicas del ligando,con el objeto de mejorar la energías de unión por medio del agregado de grupos funcionales capaces de desplazar aquellos WSs formados en presencia del ligando que se encuentren en un radio ≤ a 4 Å del mismo.