Nuevos marcadores moleculares de copia única desarrollados para estudios filogenéticos en Orchidaceae con énfasis en la subtribu Chloraeinae

BENITEZ S.; DONADÍO S.; PÉREZ F.; SALAZAR G. A. ; GRANADOS C.; CISTERNAS M. A.

Mendoza

Jornada; XXXVI Jornadas Argentinas de Botánica y XXVIII Reunión Anual de la Sociedad de Botánica de Chile; 2017

Sociedad Argentina de Botánica

Las filogenias robustas y bien resueltas documentan la historia evolutiva de los organismos, y a su vez son esenciales para la comprensión de los patrones espacio-temporales de los procesos de diversificación filogenética y evolución fenotípica. Los estudios empíricos han demostrado que se necesita un mayor número de loci de evolución independiente para resolver relaciones filogenéticas entre especies cercanamente relacionadas y de reciente radiación. Esto ha estimulado rápidos avances en el área de la filogenómica, que han sacado provecho de la secuenciación masiva para adquirir grandes conjuntos de datos de múltiples loci. Este estudio se enfoca en el diseño y secuenciación de marcadores moleculares ortólogos y altamente informativos a diversas escalas filogenéticas en orquídeas. Para ello, a partir de 84 genes nucleares de copia simple (GNCS) obtenidos del genoma recientemente publicado de la orquídea Phalaenopsis equestris, y ensamblados con datos de transcriptomas de Orchidaceae obtenidos de la base de datos pública 1KP, se diseñaron primers para la amplificación y secuenciación de 20 genes nucleares de copia única para Orchidaceae con el fin de encontrar marcadores para la reconstrucción filogenética interespecifica en la subtribu Chloraeinae y en otros clados de esta familia.