Identificación y caracterización de genes relacionados con el modo reproductivo en pasto llorón utilizando Microarreglos de cDNA

SELVA J.P.; PASTEN C.; RODRIGO J.M.; ZAPPACOSTA D.; MICHELETTO S.; GARBUS I.; ECHENIQUE V.

Rosario

Simposio; Simposio de Genómica Funcional de Plantas; 2017

Bolsa de comercio de Rosario

La apomixis es un modo de reproducción donde la reducción meiótica y la fecundación de la ovocélula no se producen y se generan progenies genéticamente idénticas a la madre. Conocer el mecanismo molecular involucrado en este tipo de reproducción permitirá en el futuro su transferencia a cultivos de interés económico como el maíz y el girasol, entre otros. El pasto llorón (Eragrostis curvula (Schrader) Nees) es una gramínea nativa del sur de África que se reproduce principalmente por apomixis diplospórica. El objetivo de este trabajo fue comparar los perfiles de expresión génica entre genotipos sexuales y apomícticos mediante microarreglos SurePrint G3 1 x 1M de Agilent. El chip se diseñó utilizando secuencias obtenidas previamente por nuestro grupo de trabajo y consistió en aproximadamente 60.000 unigenes de esta gramínea. Se realizaron ocho hibridaciones independientes (4 con ARN de genotipos sexuales y 4 con ARN de genotipos apomícticos) marcadas con un solo color (Cy-3). La calidad y reproducibilidad de las hibridaciones se verificó con controles positivos internos y mediante el software Agilent Feature Extraction 8.5. Los análisis de expresión se realizaron con GeneSpring 14.5. Utilizando el modo reproductivo como parámetro, y los datos normalizados, se encontraron 138 spots diferencialmente expresados en apomixis vs sexualidad (fold change >2, p-values < 0.01) mediante prueba t desapareada y corrección múltiple de Benjamini-Hochberg. De los 138 spots diferenciales, 78 pertenecen al mismo unigen expresado exclusivamente en los genotipos apomícticos. Se presenta un análisis preliminar de este gen.