Análisis de la estructura y función de comunidades procariotas oxidantes del amoníaco en la rizosfera de un cultivo de cobertura bajo diferentes métodos de supresión

IOCOLI, GASTÓN A.; ZABALOY, MARÍA CELINA; ALLEGRINI, MARCO; BASUALDO, JESSICA; MORALES, MARIANELA E.; VILLAMIL, MARÍA B.

La Plata

Congreso; V CONGRESO ARGENTINO DE MICROBIOLOGÍA AGRÍCOLA Y AMBIENTAL; 2021

Asociación Argentina de Microbiología

Las comunidades oxidantes del amoníacodesempeñan un rol clave en el ciclo del nitrógeno a través del proceso denitrificación. Si bien el comportamiento de las comunidades nitrificantes a lafertilización ha sido extensamente estudiado, la estructura y función de lascomunidades nitrificantes frente a la supresión de cultivos de cobertura invernales(CCI) se desconocen. Los procesos de rizodeposición y de degradación deresiduos vegetales en plantas suprimidas mecánica o químicamente podríaninfluenciar diferencialmente a las comunidades oxidantes del amoniaco y lastransformaciones del N asociadas a estos grupos. El objetivo de este estudiofue analizar si el método de supresión del CCI (Avena sativa L.) influye diferencialmente sobre la estructura de lascomunidades procariotas oxidantes del amoníaco de la rizosfera. Se realizó unensayo a campo en bloques completos aleatorizados (n = 4) durante los años 2018 y 2019 en un campo experimentalperteneciente a la Universidad Nacional del Sur (Colonia Napostá). La supresióndel crecimiento del CCI (estadio Z5.5) se realizó mediante acción mecánica (R,rolo faca de tiro manual) o química (DQ, glifosato, 3 L ha-1). Seobtuvo suelo rizosférico antes de la supresión del CCI (sin supresión, SS) entanto la rizosfera de los tratamientos DQ y R se muestreó cuando las plantasmostraron signos claros de desecación. Se extrajo el ADN metagenómico medianteel kit DNeasy PowerSoil (Qiagen, GmbH, Alemania) para su posterior análisis mediantesecuenciación masiva de amplicones del gen amoAcon la plataforma MiSeq (Illumina) y análisis de secuencias con QIIME2. Los datos se ingresaron luego en laplataforma de detección de predictores JMP® (SAS Institute Inc.) y las unidadesoperativas taxonómicas (OTUs) con una contribución mayor al 10% se analizaronestadísticamente por modelos lineales mixtos en el software estadístico SAS,previa aplicación de la transformación de Aitchison (centered-log ratio). Se realizó también un análisis multivariado delas comunidades mediante componentes principales. El análisis funcional sellevó a cabo mediante medidas de nitrificación potencial (NP). En los dos añosde estudio no se observó una separación de las comunidades en respuesta a losdiferentes tratamientos (R, DQ y SS). Asimismo, tanto las OTUs como la NP nomostraron un efecto significativo del tratamiento (P > 0.05). El análisis filogenético de BOA indicó el agrupamientode seis OTUs junto a secuencias del cluster 3 de Nitrosospira mientras que dos de las OTUs se ubicaron más próximasa representantes de los cluster 0 y 2. Los resultados demuestran que el métodode supresión del CCI no ejerce un efecto significativo en la actividadnitrificante y en la estructura de dos grupos microbianos de reconocidasensibilidad como indicadores, en dos años de manejo del suelo con CCI. Noobstante, se requieren estudios de mayor duración, con diferentes CCI y en distintossuelos para obtener evidencias concluyentes al respecto.