Análisis estadístico con R de diferentes métodos de extracción de ácidos nucleicos de Salmonella Paratyphi B para el diseño de dispositivos de detección

MAIDANA KULESZA, NOEL; SAID ADAMO, MILAGRO; RAJAL, VERÓNICA BEATRIZ; S. I. REYES; H.R. POMA

Salta

Jornada; III Jornadas Internacionales de Estadística Aplicada; 2020

Existen metodologías oficiales para la investigación y detección de patógenos que se trasmiten a través de alimentos contaminados. Estas implican técnicas microbiológicas convencionales queson laboriosas y consumen tiempo. En los últimos años se intensificó la búsqueda de nuevas tecnologías basadas en ácidos nucleicos para la detección rápida de patógenos, que garanticen la especificidad, sensibilidad y bajo costo en laboratorios miniaturizados que contemplen todas las etapas clásicas de extracción, amplificación y detección. Este trabajo propone evaluar cinco métodos de extracción de ácidos nucleicos a partir de Salmonella Paratyphi B aplicando R como herramienta estadística. Se realizaron extracciones de ácidos nucleicos a partir de cultivos puros de la bacteria en estudio y se midió su concentración mediante un espectrofotómetro de microvolúmenes. Los datos se analizaron mediante la prueba estadística no paramétrica de Kruskal-Wallis. Los resultados muestran que los métodos de extracción shock térmico y buffer de lisis permitieron recuperar concentraciones elevadas de ácidos nucleicos; aunque fueron las muestras con mayor dispersión de los datos en comparación con los otros métodos. Las pruebas estadísticas aplicadas de comparación múltiple permiten seleccionar la metodología de extracciónóptima y, aportar a la toma de decisiones en cuanto a los intereses de esta línea de investigación