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Las comunidades microbianas en el suelo regulan el funcionamiento del ecosistema y son indicadoras del impacto antrópico ya que su respuesta fisiológica refleja los cambios en las condiciones ambientales. La estructura de la comunidad puede ser medida y descripta en términos de diversidad funcional. El perfil fisiológico de la comunidad (CLPP del inglés Community Level Physiological Profile), refleja su potencial catabólico, independientemente de las especies que la conforman. Un ecosistema con una alta diversidad funcional es más eficiente en cuanto a productividad, resiliencia y resistencia.El objeto de este trabajo fue analizar si ocurrían cambios en la diversidad funcional y los patrones de consumo de las comunidades microbianas del suelo debido a la aplicación de glifosato.Se recolectaron cinco muestras de tres suelos distintos en parcelas adyacentes. Uno de ellos, con cobertura natural, fue sometido a perturbaciones sucesivas por fumigación con glifosato (RF1: sin fumigar; RF2: 24 h después de la primera fumigación; RF3: un mes después de la segunda fumigación). Los otros dos suelos fueron cultivados, con una antigüedad de fumigación continua de 5 años (RF4: monocultivo de maíz; RF5: secuencia de cultivos de poroto y garbanzo). La caracterización del CLPP de las muestras se realizó mediante el sistema EcoPlate® de Biolog® y con los datos se calcularon la respuesta metabólica promedio (RMP) y los índices de diversidad: Riqueza de uso de sustrato (Rs), Shannon-Wiener (H?) y Pielou (J?).Según el índice J? el consumo de fuentes de carbono fue uniforme en todas las muestras, aunque varió el número y tipo de sustratos utilizados. La diversidad funcional disminuyó con el incremento de perturbaciones por fumigación (RS de 25 a 13 y H? de 3,1 a 2,4). Los suelos con cobertura vegetal natural presentaron mayor potencial catabólico (RMP = 0,55±0,41) que aquellos cultivados (RMP = 0,17±0,04), y el uso de sustratos se registró a partir del tiempo cero, mientras que esto ocurrió a partir de las 48 h de inoculación para los suelos cultivados. En las muestras con cobertura natural se vio un efecto a corto plazo de disminución del potencial catabólico de la comunidad microbiana tras la fumigación (RF2) respecto al suelo sin fumigar (RF1). Sin embargo, aunque en la tercera muestra se provocaron dos eventos de perturbación (RF3), dado un período de restauración se vio una recuperación en el potencial catabólico, aproximándose la curva de RF3 al comportamiento de consumos de sustrato de RF1. También se vio un incremento de consumo de polímeros y aminoácidos con el aumento de perturbaciones con glifosato, detectando diferencias significativas en el consumo de D-Manitol, L-Fenilalanina, ácido-D-glucosamínico, L-arginina y ácido 4 hidroxibenzoico.El análisis de CLPP reveló menor diversidad funcional y potencial catabólico en los suelos con aplicación de glifosato. También reducción del consumo de D-manitol y ácido-D-glucosamínico al aumentar las aplicaciones.