Evaluación de marcadores genéticos para la identificación de la fuente de contaminación microbiana fecal en aguas.

HÉCTOR A. CRISTÓBAL; VERÓNICA RAJAL

Cordobal

Congreso; 1er Congreso Iberoamericano de protección, gestión, eficiencia, reciclado y reúso del agua.; 2013

Universidad Nacional de Córdoba, Fundea, Municipalidad de Cordoba

Se usó como método de rastreo de la fuente de contaminación microbiana (Microbial Source Tracking) en aguas, uno basado en la detección del marcador molecular ADN ribosomal 16S en Bacteroides. Estos microorganismos son los componentes naturales de la flora intestinal de animales de sangre caliente, es decir son constituyentes abundantes en las heces humana y animal. Estudios previos identificaron que este marcador genético en Bacteroides son específicos del huésped, y permiten diferenciar entre poblaciones de humanos y animales. Su detección se realiza mediante PCR cuantitativa con sistemas de cebadores y sondas TaqMan. El agua es el principal medio de la exposición humana a los peligros microbiológicos  por ingesta directa o diversas actividades. Antes de realizar la identificación de estos microorganismos en aguas, es necesario evaluar la metodología de los sistemas existentes para nuestra región geográfica. Se colectaron muestras fecales a partir de diferentes poblaciones taxonómicas (humanas y animales), las cuales fueron procesadas para la extracción de ácidos nucleicos, posteriormente empleados en su validación mediante PCR en tiempo real. Se utilizaron los sistemas para la identificación de Bacteroides humanos (BacHum, BacH-M2) y universales (AllBac, UniBac). A partir de un total de 24 muestras fecales humanas, 21 y 15 fueron verdaderos positivos para BacHum y BacH-M2, respectivamente. Ambos sistemas fueron evaluados con diferentes miembros de cada población de animales (canino, felino, equino, bovino y aviar) obteniéndose sólo reacciones cruzadas con muestras caninas (falsos positivos) para BacHum y BacH-M2. A partir de un total de 71 muestras fecales 65 y 58 fueron verdaderos positivos con el sistema AllBac y BacUni, respectivamente. De acuerdo con los resultados obtenidos la especificidad de cada sistema universal fue del 88% (AllBac) y 78% (UniBac). El primer sistema permite establecer que BacHum y Bac-HM2 identifica Bacteroides humanos con una especificidad del 87 y 57%, respectivamente; y una sensibilidad del 95% (BacHum) y 97% (BacH-M2) para diferenciarlos de los Bacteroides de origen animal. En conclusión, el sistema que permite identificar si el origen de la contaminación fecal es humano es el BacHum. Se espera que los sistemas evaluados sean aplicados con éxito en diversas fuentes de agua.