Identificación de genes en Streptomyces sp. M7 asociados con la vía degradativa del hexaclorociclohexano. Determinación de dominios y motivos conservados

POLTI M.; DAVILA COSTA J.; SINELI, P.; CUOZZO S.A.

Rosario

Congreso; Congreso Latinoamericano de Microbiología. XIV Congreso Argentino de Microbiología; 2016

ALAM-SAMIGE

Introducción: El hexaclorociclohexano (HCH) forma parte de uno de los plaguicidas organoclorados más importantes, su aplicación sumada a la producción del mismo en el pasado generó un problema actual de contaminación ambiental a nivel mundial. Se conocen diferentes microorganismos capaces de degradar el HCH, cuya vía degradativa está completamente caracterizada en el géneroSphingobium, sin embargo poca información de la misma esta reportada en el género Streptomyces. Existen estudios que demostraron la capacidad de degradación de los distintos isómeros del HCH enStreptomyces sp. M7, por lo que el objetivo del presente trabajo fue identificar, en dicho microorganismo, genes involucrados en la degradación del HCH mediante la determinación de dominios y motivos conservados.Materiales y métodos: El secuenciamiento total del genoma de Streptomyces sp. M7 se realizó mediante el uso de 600 Cycles V3 Reagent Kit (Illumina) en MiSeq (Illumina). Para la anotación del mismo se utilizó la plataforma RAST y la base de datos KEEG para determinar la función de la totalidad de las secuencias. Los alineamientos de secuencias proteicas se realizaron utilizando la matriz de identidad BLOSUM62.Resultados: En el genoma de Streptomyces sp. M7 se identificaron genes que codifican para diferentes enzimas relacionadas con la degradación del HCH. Las mismas tendrían potencialmente actividad dehidroclorinasa (linA), haloalcanodeclorinasa (linB) y alcohol deshidrogenasa (linC). En el caso delinAse identificaron tres genes los cuales poseen el dominio Snoal_4 correspondiente a la enzima LinA de Sphingobium y presentaron un 20% de identidad con esta enzima. Ademas, en dichas secuencias se identificó el sitio catalítico D25; H73. Por otra parte, se identificaron dos secuencias con potencial actividad haloalcanodeclorinasa (linB), las mismas presentaron el dominio de α/β-Hydrolasa y posibles sitios activos, ya que existe diversidad entre las diferentes secuencias descriptas. Así mismo se identificaron tres secuencias con potencial actividad alcohol deshidrogenasa (linC), cuyos dominios y motivos conservados coincidieron con la enzima descripta en Sphingobium, por ejemplo el sitio activo ?YXXK?, además de los sitios de unión a cofactores como ?TGXXXGX(1-2)G?.Conclusiones: Se identificaron genes cuyas secuencias codifican para enzimas con potenciales actividades dehidroclorinasa, haloalcanodeclorinasa y alcohol deshidrogenasa, necesarias para la degradación del HCH, en el genoma de Streptomyces sp. M7, lo que impulsa a estudiar la expresión heteróloga de los mismos.