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Turnera sidoides (x= 7) es un complejo autopoliploide cuya distribución coincide, en casi toda su extensión, con el Dominio Fitogeográfico Chaqueño. Se extiende desde el S de Bolivia, Paraguay y Brasil hasta Uruguay y Argentina, hasta los 39ºS. Cuenta con cinco subespecies taxonómicas y siete morfotipos, los que se distinguen por el grado de incisión de la lámina foliar, el indumento foliar y el color de las flores y difieren en su distribución geográfica. Presenta diversos citotipos en todas las subespecies y morfotipos, que van desde diploide (2n= 2x= 14) hasta octoploide (2n= 8x= 56). A fin de analizar los procesos genéticos e históricos que contribuyeron a la diversificación del complejo se inició el estudio de la variación del ADNcp empleando PCR-RFLP. El análisis de la distribución de los haplotipos reveló una estructuración geográfica la que sería el resultado de procesos históricos de retracción y expansión de las poblaciones. A fin de probar esta hipótesis, en este trabajo se examinan los patrones filogeográficos del complejo T. sidoides. Para tal fin, se analizó la región intergénica del ADNcp trnL- trnF en 58 poblaciones representativas del área de distribución de la especie. El alineamiento construido a partir de las secuencias fue de 310 pb, detectándose 7 sitios polimórficos y 9 haplotipos. La red haplotípica obtenida mediante el método de median-joining permitió la identificación de un haplotipo ancestral y al menos tres haplogrupos diferentes. Asimismo, el análisis de la historia demográfica del complejo obtenido a través del cálculo de la diversidad haplotípica (h=0.428) y nucleotídica (Pi=0.002) sugirió un rápido crecimiento poblacional, con poco tiempo de separación. Por otra parte, el análisis conjunto de la distribución geográfica de subespecies/morfotipos, citotipos y haplotipos reveló la existencia de dos grandes centros de variación del complejo (NW y E). El haplogrupo ancestral se distribuye en el centro NW que constituye el mayor centro de diploides hasta ahora detectado y es un área de gran variación de la subsp. pinnatifida. En el centro E, donde la distribución de las subespecies y morfotipos se superpone parcialmente y se hallaron citotipos desde diploide a octoploide, se detectó la mayor diversidad de haplotipos. En cada uno de dichos centros existirían centros secundarios de variación, los que representarían áreas de refugio o corredores de expansión y retracción de la flora. Sobre la base de los resultados obtenidos y en el marco del conocimiento actual del complejo así como de los eventos geomorfológicos y climáticos históricos ocurridos en la región, se propone un modelo para explicar la diversificación de T. sidoides.