El análisis de ARN-nifH revela filotipos relacionados con Geobacter y Cianobacteria como importantes componentes funcionales de la fijación de N en suelo

COLLAVINO M.M; AGUILAR O.M; FILIPE BEHRENDS KRAEMER; CALDEROLI PRISCILA

Mar del Plata

Congreso; IV Congreso Argentino de Microbiología Agrícola y Ambiental (CAMAYA) I Jornada de Microbiología General (MicroGen).; 2018

Camaya

Las bacterias del suelo con capacidad de fijar N2 en vida libre presentan un alto grado de diversidadtaxonómica y fisiológica. Previamente encontramos que el perfil de estas comunidades esfuertemente afectado por las características químicas y físicas del suelo en una relación suelotratamiento específica (Collavino y col., Env Microb 2014). Sin embargo, la presencia de secuenciasnifH en el ADN de suelo no indica necesariamente que las mismas correspondan a bacteriasactivas en la fijación de nitrógeno. La fijación de N2 es un proceso fuertemente regulado en todoslos microorganismos estudiados y su expresión depende de varios factores ambientales (Bürgmanny col., 2005). En este estudio nos propusimos estudiar la población fijadora activa considerandodiferentes profundidades y tratamientos bajo siembra directa mediante el análisis de secuenciaciónmasiva de ADNc-nifH. Encontramos que la diversidad es significativamente mayor en el suelo nocultivado y, a su vez es afectada por la profundidad en forma dependiente del tratamiento agrícola.Los filotipos relacionados con Geobacter, Rhizobiales, Cyanobacteria, y Verrucomicrobiales soncomponentes activos claves de la fijación de N2. Es interesante destacar que en la comunidaddiazotrófica potencial los grupos como Geobacter y Rhizobiales son también predominantesmientras que, por el contrario, los órdenes Cianobacteria y Verrucomicrobia estuvieron pobrementerepresentados. La cuantificación de los filotipos Geobacter y Cyanobacteria por qPCR demostróque estos grupos son abundantes en suelos bajo rotación intensiva y bajo monocultivo de soja,respectivamente. La correlación con propiedades físico-químicas del suelo mostró que laestabilidad física del suelo y el carbón orgánico contribuyen a la funcionalidad de ciertaspoblaciones y promueve una mayor diversidad de grupos diazotróficos, este incremento en ladiversidad podría deberse a la presencia de diferentes nichos (poros de diámetros diferentes), y laestabilidad estructural de los mismos (Calderoli y col., MicrobiologyOpen 2017). Combinando losresultados obtenidos del análisis de la comunidad diazotrófica potencial y activa, es posible concluirque las características edáficas y el uso agronómico afectan significativamente la estructura de lasmismas y que la distribución de algunos grupos filogenéticos parece estar asociada acaracterísticas particulares del suelo, abriendo así la posibilidad de su aplicación como marcadoresde calidad.