DESARROLLO DE MARCADORES EST-SSR EN PASPALUM NOTATUM A PARTIR DE BASES DE DATOS PUBLICAS DE ARROZ Y MAÍZ

SIENA LA; FELITTI, S; ORTIZ JPA

Rosario, Argentina

Congreso; VII Simposio Nacional de Biotecnología REDBIO - Argentina. II Congreso Internacional - REDBIO - Argentina; 2009

REDBIO Argentina

A partir de los datos derivados de los proyectos de secuenciación en vegetales se han desarrollado los marcadores del tipo EST-SSR. Estos marcadores corresponden a secuencias expresadas que contienen repeticiones cortas de nucleótidos internos. Los EST-SSR han demostrado tener una buena capacidad para detectar polimorfismos y una alta frecuencia  de transferencia entre especies. Estas características hacen que los mismos sean especialmente útiles en estudios de mapeo comparativo. El objetivo de este trabajo fue desarrollar marcadores EST-SSR en P. notatum a partir de datos públicos de arroz y maíz. Se seleccionaron 49 marcadores de las bases Ksum y cnl distribuidos uniformemente en el genoma de arroz. La secuencia de cada marcador se mapeó in sílico en el programa Gramene (www.gramene.org) para verificar la presencia y localización de secuencias homeólogas en maíz y trigo. Hasta el momento 12 marcadores fueron ensayados sobre el ADN genómico de los genotipos Q4188 yQ4117 de P. notatum utilizando cebadores específicos. En promedio se obtuvieron 10 bandas de entre 800 y 120 pb y 6 fragmentos polimórficos por marcador. Dos amplicones del tamaño esperado fueron clonados y secuenciados a fin de determinar su identidad. Cinco marcadores segregantes 1:1 por presencia ausencia fueron mapeados en una población segregante del tipo pseudotestcross derivada de los genotipos anteriores y localizados en el mapa genético de la especie. Estos resultados demuestran que es posible desarrollar un conjunto de marcadores EST-SSR de P. notatum y utilizarlos en experimentos de mapeo comparativo.