DESARROLLO Y LOCALIZACIÓN DE MARCADORES FUNCIONALES EN Paspalum notatum

STEIN J; PESSINO SC; ORTIZ JPA; QUARIN CL

Pergamino, Pcia. de Buenos Aires, Argentina

Congreso; XXXVI Congreso Argentino de Genética; 2007

Sociedad Argentina de Genética

Recientemente se ha desarrollado un mapa genético de P. notatum a nivel tetraploide en base a marcadores de AFLP. Paralelamente se identificaron transcriptos de expresión diferencial correspondientes a diferentes ploidías y/o modos de reproducción de la especie. Varios de ellos mostraron, homología a genes de funciones conocidas. El objetivo del presente trabajo fue localizar un conjunto de genes en el mapa de P. notatum. La generación de los marcadores funcionales se basó en la identificación de variaciones en la secuencia que se manifiestan en la conformación de las hebras simples (SSCP). Se diseñaron oligonucleótidos específicos para 8 clones relacionados a la apomixis en Paspalum notatum y 1 en Poa pratensis y para 23 clones de expresión diferencial a distintas ploidías. Se realizaron las amplificaciones de PCR sobre ADN de los genotipos parentales y el desarrollo de los marcadores SSCP se basó en la detección de los polimorfismos en geles nativos de MDE (Cambrex) y tinción con nitrato de plata (Promega). Posteriormente, se analizaron los marcadores generados sobre una muestra de 70 individuos de la población de mapeo. El análisis de ligamiento se realizó empleando el programa Mapmaker 3.0 con valores de LOD entre 6.0-3.0 y un r (máx) = 0.39. La  presencia y orden de los marcadores obtenidos se comparó in silico con la disposición que presentan los genes en mapas de otras gramíneas. Los resultados obtenidos permitieron localizar genes relacionados con cambios de ploidía y modo el modo de reproducción en el genoma de P. notatum.