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Paspalum notatum es una gramínea forrajera rizomatosa nativa de Sudamérica difundida en las regiones tropicales y subtropicales de Brasil, Paraguay, Uruguay y Argentina. La especie forma un complejo agámico en el cual los citotipos diploides son sexuales y autoincompatibles, mientras que los poliploides (en su mayoría tetraploides) son apomícticos y autofértiles. Con el objetivo de definir un marco genético para la especie y caracterizar el locus responsable de la aposporía se desarrolló un mapa de ligamiento al nivel tetraploide (2n=4x=40). La construcción del mapa se basó en el análisis de 680 marcadores de AFLP y la detección de alelos en dosis simple (SDA). El mapa materno presentó 26 grupos de cosegregación cubriendo 1.590 cM. El mapa paterno mostró 39 grupos y una longitud de 2.265 cM. En este último se identificó el grupo de ligamiento que contiene al locus responsable de la aposporía en el cual 15 marcadores resultaron completamente ligados al carácter (bloque-apo). El análisis de marcadores ligados en repulsión determinó que este bloque presenta apareamiento preferencial con 1 de los 3 homólogos. Una estimación del tamaño físico del mismo sugiere que se trata de un segmento de gran tamaño (aproximadamente 40 Mpb). Dos marcadores completamente ligados a la aposporía mostraron homología con genes gag/pol de elementos transponibles de maíz y southern blots con enzimas sensibles a metilación determinaron que la región se encuentra metilada. Estos resultados indican que la aposporía en P. notatum está controlada por un locus complejo (que puede incluir varios genes asociados por función y aislados por recombinación) caracterizado por la presencia de elementos móviles y metilación de citocinas. El mapa desarrollado en este trabajo constituye un marco genético para la localización de genes de importancia agronómica y contribuye a determinar los factores genéticos responsables de la apomixis en la especie.