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Los arroyos y ríos en las regiones semiáridas son sensibles al cambio climático ya que las pequeñas alteraciones climáticas pueden producir grandes variaciones en esos cuerpos de agua. Eventos hidrológicos causados por las condiciones de El Niño - se han identificado claramente en los ríos de América del Sur. Estos procesos fueron pronunciados en particular durante los eventos de 1982-1983 y 1997-1998. Estos episodios influyeron en los ecosistemas terrestres, principalmente mediante la alteración de los patrones de precipitaciones, la temperatura y la disponibilidad de luz; afectando la productividad primaria y estrategias reproductivas de las especies. En los ríos de llanura, la biomasa de fitoplancton está influenciada por caudal, temperatura, transparencia, y el pastoreo que pueden modificarse directa o indirectamente como resultado del cambio climá- tico. El río Salado es un río típico de llanura, con una cuenca de unos 150.000 km2. Tiene una longitud aproximada de 571 km y baja pendiente (media de 0,107 m km-1). El caudal fluctúa de no más de 100 m3 s-1 en periodos de sequía hasta 1.500 m3 s-1 durante inundaciones, con las con- siguientes variaciones en la conductividad y el transporte de material disuelto y particulado. La cuenca incluye una de las regiones agrícolas más productivas del país. En este trabajo se analiza el fitoplancton registrado en el sector inferior del río Salado (Buenos Aires, Argentina) durante 10 años (1995-2005) para relacionar las alteraciones en la estructura del fitoplancton como resultado de cambios ambientales. Se describen los cambios estructurales del plancton que ocurrieron en toda la cuenca durante el evento del Niño (marzo 1997- enero 1998) y de La Niña (mayo1998 - mayo 1999). Asimismo, se comparan variables físico-químicas para identificar posibles indi- cadores de una relación entre las anomalías climáticas, hallando diferencias significativas en la concentración de polifenoles disueltos, fósforo reactivo particulado y la alcalinidad. La densidad de las clorofitas aumentó durante La Niña (enero 1998: 2305 individuos ml-1, enero 1999: 99337 individuos ml-1) al igual que la riqueza específica del fitoplancton (enero 1998: 24 especies, enero 1999: 57 especies) mientras que los valores de diversidad (índice de Shannon & Wiener) fueron menores (enero 1998: 4,14, enero 1999: 2,42) como consecuencia del predominio numérico de Monoraphidum minutum (87480 individuos ml-1). Tanto en condiciones hidrológicas normales o extremas predominaron clorofitas móviles (especies de Chlamydomonas) y no móviles (especies de Monoraphidium), típicas de ambientes eutróficos. Un análisis detallado de las clorofitas en toda la cuenca indica que los cambios en la dominancia se registraron en una escala regional, aunque se identificaron asociaciones particulares en sectores de la cuenca. Después del episodio de La Niña, en toda la cuenca se volvieron a registrar los valores próximos a la media en la densidad fitoplanctónica, lo que revela la capacidad de restablecer condiciones generales de estabilidad frente al efecto del ENSO. En lo referente al zooplancton, no se produjeron diferencias marcadas en la densidad durante el período 1995-2005, sin embargo si se detectan cambios estructurales al comparar sólo los muestreos de verano de 1998 y de 1999 que representan las condiciones más marcadas del Niño y La Niña, respectivamente. En ambos eventos, varios rotíferos planctónicos típicos de ríos con elevada conductividad fueron dominantes (Brachionus plicatilis, B. angularis, Trichocerca pusilla, Filinia longiseta y Keratella tropica). La principal diferencia entre ambos eventos fue la casi completa ausencia de crustáceos durante el período de La Niña de enero de 1999 (densidad total rotíferos: 911 individuos l-1, crustáceos: 2 individuos l-1) respecto a enero 1998 (rotíferos: 411 individuos l-1, crustáceos: 58 individuos l-1). El período con mayor abundancia rotíferos coincidió con condiciones de aguas bajas, mayor conductividad, menor conectividad del río con cuerpos lénticos y un marcado incremento de un alga palatable como M. minutum. Palabras clave: eventos ENSO, río de llanura, plancton, efectos estructurales