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Se investigó el efecto de la composición de la materia prima (% de ácidos grasos libres y metanol), la presencia o ausencia de humedad y el contacto con biodiesel en la estabilidad de Novozymâ 435 durante la producción de biodiesel. En este sentido se estudió la estabilidad catalítica (conversión), la estabilidad física (pérdida de soporte polimérico y/o enzima al medio de reacción) del biocatalizador, la modificación de textura interna y externa, y el efecto sobre la estructura secundaria de la enzima. La remoción continua de la humedad provocó desactivación del biocatalizador y favoreció la degradación del polimetilmetacrilato (PMMA) que constituye el soporte de la lipasa CALB. Sin embargo, la presencia de PMMA y de proteína se detectó en el medio de reacción independientemente de las condiciones de operación. Sorprendentemente, el biodiesel (sin presencia de metanol) es capaz de difundir al interior de las esferas de biocatalizador provocando hinchamiento, modificación de su textura interna y modificación de la estructura enzimática.