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En el presente trabajo se estudiaron variaciones temporales de la comunidad fitoplanctónica en relación a concentraciones de plaguicidas (Atrazina y endosulfán) y micro contaminantes inorgánicos (Cr, Cu, Pb, y As) registrados en agua y sedimentos en el Sistema de arroyos Colastiné-Corralito Santa Fe, Argentina).Se realizaron muestreos mensuales durante un año en cuatro sitios (S1, S2, S3, S4) Se midieron variables fisicoquímicas in situ y en laboratorio, se determinaron las concentraciones de metales pesados y arsénico en agua y sedimento, y plaguicidas en agua. Las concentraciones de xenobióticos registradas en los cuatro sitios y doce meses se correlacionaron con los cambios estructurales registrados en la comunidad fitoplanctónica.Los valores de Cr, Pb y Cu registrados en agua superaron ampliamente los niveles guías propuestos para la protección de la biota acuática (el Cr los superó 137 y 143 veces; Pb 87 y 97 veces y Cu 35 veces). La concentración de atrazina fue mayor que la de endosulfán. Si bien el primero no sobrepasó los niveles guías, el endosulfán los superó en el 70,83% de los casos.En agua, el 97,91% de las muestras con Cr superó los niveles guía, el Cu los hizo en 70,83%, el Pb en 97,91% y el As en 43,75%. En sedimento, 2,08%, 4,16%, 39,58% y 14,58% de las muestra sobrepasaron los niveles guía para el Cr, Cu, Pb y As respectivamente.La riqueza y la densidad por sitio mostraron el siguiente orden decreciente: S2>S3=S4>S1 y S2>S3>S4>S1, respectivamente. Las Bacillariophyceae y Clorophyceae fueron dominantes en todos los sitios a lo largo del estudio. La densidad mensual mínima re registró en noviembre y agosto en S1 (50 y 90 ind/l), mientras que la máxima en enero y octubre en S2 (196190 y 137880 in/l).Se observó una correlación positiva y significativa entre la riqueza de especies y las precipitaciones (r=0,4; p=0,005). Contrariamente, la riqueza disminuyó con el incremento de la conductividad (r=-0,4; p=