Reconocimiento de estructuras nativas de proteínas globulares

RENZI, DANILO G.; STOICO, CÉSAR O.; VERICAT, FERNANDO

Ciudad Autónoma de Buenos Aires

Congreso; 93 Reunión Nacional de Física de la Asociación Física Argentina, XI Reunión de la sociedad Uruguaya de Física y Primera Reunión conjunta AFA-SUF.; 2008

Asociación Física Argentina

Sabemos que la función biológica que cumple una proteína globular está determinada por su plegamiento o estructura nativa. A su vez, la información necesaria para que la proteína se pliegue hasta alcanzar su estructura nativa estaría contenida en la secuencia de aminoácidos que la forman. Existen diversas técnicas experimentales para determinar tanto la estructura como la secuencia de una proteína desconocida. Sin embargo, la secuencia se determina de un modo mucho más rápido que la estructura. Por este motivo, sería importante contar con un método ágil que reduzca esta brecha. En este trabajo presentamos un modelo simple que procura reconocer (más que predecir) la estructura nativa de una dada proteína a partir de su secuencia de aminoácidos, identificándola dentro de un conjunto de plegamientos posibles utilizados como “moldes”. Considerando la complejidad del problema y la simplicidad del modelo, los resultados obtenidos hasta este momento muestran un comportamiento aceptable, aunque seguimos trabajando para mejorar el modelo.