Una aplicación de los potenciales de fuerza media entre aminoácidos obtenidos mediante una teoría mecánico-estadística de líquidos clásicos

RENZI, DANILO G.; STOICO, CÉSAR O.; VERICAT, FERNANDO

San Carlos de Bariloche, Río Negro

Congreso; VI Taller Regional de Física Estadística y Aplicaciones a la Materia Condensada (TREFEMAC 07).; 2008

Desde que Anfinsen en 1973 encontró que la secuencia de aminoácidos de una proteína especificaba com- pletamente su estructura tridimensional nativa, la investigación en este campo se orientó hacia la búsqueda de la ley o código que determina el plegamiento. El criterio más utilizado propone como estructura de una dada secuencia, a aquella de más baja energía libre en condiciones fisiológicas normales. Con este criterio, las funciones de energía utilizadas para el cálculo, resultan un elemento clave. En este trabajo, utilizamos un modelo simplificado para buscar la estructura nativa de algunas proteínas globulares a partir de su secuencia de aminoácidos, dentro de un conjunto de conformaciones posibles. Para el cálculo, hacemos uso de los potenciales de fuerza media entre pares de aminoácidos que obtuvimos previamente mediante una teoría perturbativa de líquidos clásicos. De esta manera, avanzamos sobre dos objetivos: por un lado, desarrollar un algoritmo capaz de predecir la estructura nativa de proteínas a partir de su secuencia de aminoácidos, y al mismo tiempo, poner a prueba a los potenciales que hemos calculado mediante la teoría mecánico-estadística.