Estudio de la diversidad estructural y funcional de consorcios bacterianos degradadores de hidrocarburos obtenidos a partir de sedimentos de agua dulce con historia de contaminación

DEL PANNO M.T.; AGNELLO A.C.; MADUEÑO L.; FERNANDEZ N.; MORELLI I.S.

Congreso; IV CAMAYA I MICROGEN; 2018

La obtención de consorcios bacterianos a partir demuestras ambientales contaminadas, su estudio por métodos de secuenciación y suanálisis con nuevas herramientas bioinformáticas, constituyen un buen modelo deestudio para conocer los microorganismos y las vías metabólicas implicados enla degradación de contaminantes. Con este objetivose caracterizó la diversidad estructural y funcional de consorcios bacterianosdegradadores de hidrocarburos provenientes de sedimentos de agua dulce contaminados.Setomaron muestras de sedimentos a 20 y 40 cm de profundidad (P20 y P40)a partir de las cuales se obtuvieron, por repiques sucesivos, tres consorciosmicrobianos en presencia de octadecano (O) o fenantreno (F) como única fuentede carbono. Se extrajo el ADN de los consorcios (P20F, P40F,P40O), se amplificó la región V4 del gen ARNr 16S y se secuenció enla plataforma Illumina Miseq. Losdatos de secuenciación se utilizaron para realizar la asignación taxonómica (Pipeline Microbiome Helper16S Workflow) y funcionalprediciendo in silico el contenido metagenómico funcional delgen marcador ARNr 16S (software PICRUSt).Si bien los índices estimadores de diversidad fueronsemejantes en los tres consorcios (Chao1: ~92.0, Shannon: ~2.27, Simpson: ~0.81),no se observó similituden su composicióntaxonómica y filogenética en el análisis de coordenadas principales. La asignacióntaxonómica reveló características particulares en cada muestra, siendo lasfamilias más predominantes: Sphingomonadaceae(44.9%) y Pseudomonadaceae (40.8%) enP20F, Pseudomonadaceae (37.5%) y Xanthomonadaceae (26.9%) en P40F y Gordoniaceae (41.3%) y Burkholderiaceae (15.2%) en P40O. Según lapredicción funcional los tres consorcios presentaron el potencial génico parala degradación de hidrocarburos aromáticos y alifáticos, independientemente delhidrocarburo usado para su obtención. Habiendo sido identificados once genesimplicados en la degradación de hidrocarburos alifáticos y ocho implicados enla degradación de aromáticos, no siempre se halló una correspondencia entre elnúmero de secuencias y el tipo de hidrocarburo usado para obtener el consorcio.Finalmente, la contribución de taxones para algunos de esos genes puso demanifiesto el fenómeno de redundancia funcional.Se espera que el conocimiento de la diversidad estructural y funcional de losconsorcios permita inferirel comportamiento de comunidades microbianas autóctonas para favorecer eldesarrollo de estrategias de biorremediación.