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Los recientes aislamientos y estudios de bacterias endófitas fijadoras de nitrógeno en varias pasturas y cereales dan lugar a un nuevo período en el campo del uso de microorganismos beneficiosos para la agricultura. Estos diazótrofos son una herramienta promisoria para la disminución del uso de fertilizantes nitrogenados en diversos cultivos. A diferencia de lo que ocurre en la simbiosis Rhizobium-leguminosa no se han encontrado, hasta el momento, estructuras especializadas similares a nódulos u otros cambios morfológicos evidentes en pasturas o cereales colonizados por estos microorganismos. El sistema radicular de las plantas ofrece varios microhábitats posibles para el desarrollo bacteriano y la infección y colonización de los mismos. Los experimentos de aislamiento y recuento bacteriano en plantas (tanto en raíces como en hojas y tallo) esterilizadas superficialmente nos dan una estimación del tipo y grado de colonización, pero no proveen información de los posibles sitios de infección y de cuales han sido los tejidos colonizados. Para ello es necesario localizar e identificar a los microorganismos a través de estudios microscópicos que aseguren que la bacteria no fue translocada durante la preparación del material de la planta. En el presente trabajo estos procedimientos han sido aplicados a plantas de sorgo dulce y trigo inoculadas con Gluconacetobacter diazotrophicus, diazótrofo endófito natural de caña de azúcar. Hemos aislado a este microorganismo de plantas de sorgo dulce inoculadas tanto en primordios de raíz (raíces de 24 hs) como en semillas. Los recuentos de bacterias viables realizados en raíces de sorgo inoculado (de hasta 30 días de crecimiento en Fahraeus semisólido), esterilizadas superficialmente, son del orden de 104 UFC/planta (similar a los observados para otros microorganismos endófitos en plantas tales como caña de azúcar, arroz, etc.). Para realizar los estudios de interacción planta-microorganismo se empleó la cepa UAP 5541 de G. diazotrophicus que contiene el plásmido pRGS561 con el gen reportero que codifica la enzima ß-glucuronidasa. En plantas de sorgo dulce, luego de 1 a 2 días de inoculadas, se encontró un patrón de colonización similar al reportado para maíz inoculado con este microorganismo. La primera porción de la raíz fue siempre colonizada así como numerosos pelos radicales. En plantas de 10 días se observó microscópicamente la presencia de numerosas bacterias, aparentemente en espacios intercelulares, y algunas rodeadas de una cubierta que podría ser de exopolisacárido. A diferencia de lo reportado para plantas de arroz, maíz y trigo inoculadas con este organismo, el mismo se pudo aislar de hojas y tallo de plantas de sorgo dulce de 30 días, aunque la concentración bacteriana fue menor en estos tejidos que en raíz (103 UFC/ml). En plantas de trigo de 7 días, el recuento de bacterias viables fue del orden de 104 UFC/planta, pero además de observarse pelos radicales con numerosos microorganismos teñidos de color azul, se observó el ápice de las raíces jóvenes fuertemente colonizado.