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Tradicionalmente el secado del café pergamino húmedo en Colombia, se realiza por secado solar y aire caliente. El tiempo, la temperatura, color del grano y principalmente el contenido de humedad final entre 10-12 % b.h. se utilizan para establecer el punto final del proceso, para su comercialización y obtener buenas características sensoriales en el tostado, molienda y prueba de taza. En este trabajo se estudiaron los cambios en las características físicas (dimensiones, porosidad y factor de forma) y parámetros hidrodinámicos (velocidad de fluidización) del café pergamino húmedo en lecho fluidizado y secado por microondas, utilizando un diseño factorial 32 (velocidad del aire: 2, 4 y 6 m/s con 50, 80 y 100% de potencia del microondas) para diferentes tiempos de proceso hasta alcanzar el mismo nivel de humedad final. La fluidización del grano de café pergamino húmedo se obtiene usando un sistema de laboratorio diseñado para el proceso. El equipo consiste en un circuito en el cual el aire ingresa al sector de secado a través de una placa (33 cm x 32 cm) con un tamaño de orificios de 5 mm con una distancia entre ellos de 7 mm (2116 orificios). En el sector de secado, el producto en estado fluidizado, fue irradiado mediante un magnetrón (1000 W). A partir de los experimentos se obtuvieron las condiciones óptimas del secado teniendo en cuenta como variables, la velocidad del aire y la potencia del magnetrón. La mejor condición para obtener un producto con características organolépticas de excelente calidad a nivel sensorial (prueba de taza) fueron: velocidad del aire de 4 m/s con 100% de potencia del microondas en 72 minutos, con una reducción del contenido de humedad de hasta 11.3% b.h. Además se determinó la difusividad efectiva del agua mediante el uso de la segunda ley de Fick y se observó una variación entre 9.1910-12 y 1.3310-11 m2/s para las muestras de café pergamino. La dependencia del coeficiente de difusión efectiva con la potencia de microondas siguió una relación de tipo Arrhenius. La energía de activación y factor pre-exponencial para la difusión de humedad se determinó como 2.9 W/g y 210-10 m2/s.