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Desde hace décadas es bien conocida la existencia de estratificación socioeconómica de la ancestría en poblaciones cosmopolitas americanas, en las que el componente nativo (o el africano, cuando presente) está sobrerrepresentado en los estratos más desfavorecidos. Tucumán es la provincia más densamente poblada del noroeste argentino, y tiene gran importancia histórica como atractora de migrantes provenientes tanto del resto del país como de países limítrofes y ultramarinos. Los objetivos de este trabajo son cuantificar los aportes nativos y alóctonos al acervo génico de linajes maternos en dos muestras de la localidad de San Miguel de Tucumán, y analizar la existencia de estructuración por nivel socioeconómico.Se obtuvieron muestras biológicas e información genealógica y de ancestría de donantes voluntarios en el Banco Central de Sangre (N=133) y en un laboratorio privado (N=85) de San Miguel de Tucumán. Se analizaron los linajes maternos mediante un ensayo múltiplex pcr-aplp para determinar membrecía a los haplogrupos nativos (A-D,) y alóctonos (M, N y L[xM,N]) del árbol mitocondrial humano. Los linajes atribuídos al macro-haplogrupo N fueron asignados a los haplogrupos H, J, K, T, U, V, W e I/X mediante ensayos pcr-aplp. En aquellos linajes asignados a los clados alóctonos L[xM,N] y M se obtuvo la secuencia de la región control completa con el objetivo de determinar con mayor resolución su haplogrupo de pertenencia y posible origen regional/continental. El haplogrupado de las secuencias fue realizado siguiendo a Bandelt y cols. y refinado con las herramientas web Mitotool y Haplogrep 2.0. Se hallaron diferencias significativas en los componentes nativo/alóctono para la muestras del Banco Central de Sangre (0,917 / 0,083) y del laboratorio privado (0,647 / 0,353). Linajes asignables al haplogrupo M1 de probable origen árabe fueron detectados exclusivamente en la muestra del laboratorio privado.