ANÁLISIS DE PIROSECUENCIACIÓN PARA CARACTERIZAR LAS POBLACIONES BACTERIANAS EN SUELOS SOMETIDOS A DIFERENTES CONDICIONES DE MANEJO BAJO RÉGIMEN DE SIEMBRA DIRECTA.

EVA L. M. FIGUEROLA; GUERRERO, L. D.; WALL, L.G.; ERIJMAN L.

Bs. As.

Congreso; XII CONGRESO ARGENTINO DE MICROBIOLOGÍA; 2010

AAM

El presente estudio se realizó en el marco del proyectointerdisciplinario BIOSPAS (www.biospas.org), cuyo objetivo generales identificar indicadores biológicos de calidad de suelo. Losmicroorganismos del suelo participan en funciones de vital impor-tancia para la sustentabilidad de los agroecosistemas, tales comola descomposición y mineralización de materia orgánica, el cicladode nutrientes y la modificación de la estructura edáfica. Los méto-dos de secuenciación masiva de fragmentos variables del ADNr 16Spermiten el estudio de la diversidad microbiana con una coberturaque supera en tres órdenes de magnitud la de los métodosmoleculares tradicionales. El muestreo se llevó a cabo en junio de2009. Se seleccionaron 4 localidades a lo largo de una línea oes-te-este en la zona agrícola más productiva de la Argentina:Bengolea (Córdoba), Monte Buey (Córdoba), Pergamino (Bs As) yViale (Entre Ríos). En cada localidad se tomaron muestras por tri-plicado de la fracción entre 0-10 cm de profundidad para los 3 tra-tamientos: 1- Ambiente Natural (AN): ambiente natural con míni-ma actividad antrópica, Ej.: reserva natural, montes, parques. 2-Malas Práctias Agrícolas en Siembra Directa (MP): campos mane-jados con mínima rotación o monocultivo y deficiente nutrición. 3-Buenas Prácticas Agrícolas (BP): Manejo permanente en sistemade siembra directa con rotación intensiva, fertilización de reposición,manejo integral de plagas, malezas y enfermedades, incluyendoconceptos básicos de Agricultura Certificada. Sobre ADN extraídose amplificaron las regiones variables V1+V2+V3 del ADNr 16S deldominio Bacteria. Cada uno de los triplicados fue procesado inde-pendientemente y mezclados antes del análisis. Las muestras co-rrespondientes a cada sitio y tratamiento fueron etiquetadas pormedio de un fragmento adicional de 12 bases presente amboscebadores (27F-538R), con el objeto de secuenciarlas simultánea-mente en formato multiplex (GS-FLX Platinum, Macrogen). Lapirosecuenciación generó un total de 398832 secuencias de másde 100 b (promedio 390 b). El análisis bioinformático se realizó conlos pipelines del Ribosomal Database Project y PANGEA. En to-das las muestras los Phyla dominantes resultaron serProteobacteria y Actinobacteria, con abundancias entre 25 y 58%y 15 y 50% respectivamente. Dentro de estos, las clases predomi-nantes fueron Actinobacteria (13-35%) y Alfaproteobacteria (11-38%). A este nivel no se detectaron diferencias significativas (<alpha0,005) entre tratamientos o entre sitios. Las abundancias obteni-das para Phylum y Clase fueron confirmadas utilizando primersespecíficos por PCR cuantitativo. A nivel Familia, el análisis decorrespondencia canónica (CCA) indica un agrupamiento de lasmuestras por sitio. Sin embargo, en algunos casos, la presencia y/o abundancia de ciertos grupos bacterianos a distintos grados deresolución taxonómica resultan características del régimen de ma-nejo del suelo. Estos resultados, confirmados por PCR cuantitati-vo utilizando cebadores específicos, indican la presencia de poten-ciales indicadores bacterianos de calidad de suelo.