INGEBI   02650
INSTITUTO DE INVESTIGACIONES EN INGENIERIA GENETICA Y BIOLOGIA MOLECULAR "DR. HECTOR N TORRES"
Unidad Ejecutora - UE
congresos y reuniones científicas
Título:
LOCALIZACIÓN CROMOSÓMICA Y ANÁLISIS ESTRUCTURAL DE LOS GENES stcdpk2 Y stcdpk3
Autor/es:
CAROLINA GRANDELLIS; VERÓNICA GIAMMARIA; SERGIO FEINGOLD; RITA ULLOA
Lugar:
Rosario
Reunión:
Congreso; XIII Reunion Latinoamericana XXVII Reunion Argentina de Fisiologia Vegetal; 2008
Institución organizadora:
SAFV
Resumen:
El genoma de Solanum tuberosum esta siendo secuenciado, lo cual permitirá entender los procesos biológicos del desarrollo y el comportamiento del cultivo. Estudiar la organización y estructura de los genes permite descubrir su función, mecanismos de regulación transcripcionales, post-transcripcionales y el modo en que interaccionan los genes y sus productos. Las plantas poseen vías de señalización para responder a estímulos endógenos o ambientales. Las CDPKs (Quinasas de proteínas dependientes de calcio), son sensores de cambios en los niveles de calcio generados por dichos estímulos. Varias CDPKs se expresan diferencialmente durante la brotación y transición estolón-tubérculo, entre ellas están las isoformas 2 y 3. Objetivo: Realizar un análisis genómico de stcdpk2 y stcdpk3, obtener su localización cromosómica, analizar la distribución de intrones y exones, la composición de los mismos y similitud de secuencia. Materiales y Métodos: para la localización cromosómica se utilizó la técnica de Polimorfismo Conformacional de Simple Hebra (SSCP) con primers específicos de regiones intrónicas. Se obtuvieron los clones genómicos a partir de PCRs sobre BACs conteniendo ambos genes. Se analizó la composición exónica/intrónica y similitud de secuencias con otras especies. Resultados: StCDPK2 tiene una longitud estimada de 5700 pb desde el ATG hasta el codón stop, posee 8 exones y 7 intrones. Ex1, Ex2 y Ex3 codifican el dominio catalítico de quinasa de proteínas ser/thr mientras que Ex4 abarca la región bisagra y 4 exones pequeños codifican el dominio de unión a calcio. En análisis filogenéticos se comparó la posición de los intrones para determinar relaciones evolutivas entre familias de proteínas, nuestro análisis permite incluir al gen en el sub-grupo IIa correspondiente a la clasificación de CDPKs de Arabidopsis y arroz al igual que StCDPK1. StCDPK3 tiene una longitud estimada de 6100 pb desde el ATG hasta el codón stop. Este gen posee 6 exones y 5 intrones. Ex1 codifica el dominio catalítico de quinasa de proteínas ser/thr. El Ex 2 abarca la región bisagra y Ex 3, 4, 5 y 6 codifican el dominio de unión a calcio. De acuerdo a su secuencia codificante se incluye esta isoforma en el sub-grupo IIa, sin embargo la estructura del gen difiere de la de otros miembros de este grupo. La localización cromosómica indica que StCDPK2 se encuentran en el cromosoma 7 y StCDPK3 en el 3. El análisis por Southern blot utilizando sondas intrónicas determinó que ambos genes son de copia única. Este proyecto se financia con UBACYT, PIP-CONICET y PICT