IQUIFIB   02644
INSTITUTO DE QUIMICA Y FISICOQUIMICA BIOLOGICAS "PROF. ALEJANDRO C. PALADINI"
Unidad Ejecutora - UE
congresos y reuniones científicas
Título:
La distribución superficial de diazirina en alfa lactalbúmina bovina: un estudio de dinámica molecular
Autor/es:
SABECKIS, LURDES ; GONZALEZ LEBRERO MC; DARIO ESTRIN
Lugar:
Ciudad Autónoma de Buenos Aires
Reunión:
Congreso; XL Reunión anual de la Sociedad Argentina de Biofísica.; 2011
Institución organizadora:
Sociedad Argentina de Biofísica
Resumen:
La diazirina (DZN: CH2N2 ) es una molécula pequeña que -mediante foto-disociación- produce el birradical metileno (:CH2). En su estado singulete, esta especie resulta altamente reactiva con enlaces X-H (X=C, O, N y S), de modo que se postula la modificación del entorno molecular inmediato, independientemente de su naturaleza química. Por estas características se ha empleado DZN para investigar experimentalmente la superficie expuesta al solvente (solvent accessible surface area: SASA) y las cavidades en proteínas 1-4. La metilación de residuos de aminoácido ha sido demostrada extensamente en el modelo de estudio alfa lactalbúmina bovina en varios estados conformacionales 1,2. Allí se advierte que el grado de metilación resulta prima facie proporcional al área expuesta, lo que supone una distribución razonablemente homogénea del reactivo. En este trabajo nos proponemos analizar -mediante dinámica molecular clásica (MD)- la distribución de DZN en la superficie de alfa lactalbúmina, permitiéndonos así refinar la interpretación experimental e iluminar acerca de la unión de ligandos pequeños con la misma. La intervención de DZN sobre este sistema permite ilustrar características generales de la superficie proteica que resultan fundamentales para comprender el plegado y las interacciones.