IQUIFIB   02644
INSTITUTO DE QUIMICA Y FISICOQUIMICA BIOLOGICAS "PROF. ALEJANDRO C. PALADINI"
Unidad Ejecutora - UE
capítulos de libros
Título:
Desifrando códigos: estructura y plegamiento de proteínas
Autor/es:
CRISTINA MARINO BUSLJE; JAVIER SANTOS
Libro:
Anales de la Reunion Interdisciplinaria Ventania (RIV)
Editorial:
Universidad de Bahía Blanca
Referencias:
Lugar: Bahia Blanca; Año: 2007; p. 1 - 14
Resumen:
Estructura tridimensional de una proteínaLa estructura tridimensional de una proteína es el resultado del plegamiento de la secuencia aminoacídica o estructura primaria. Los aminoácidos se disponen en el espacio en dos formas geométricas básicas que se repiten, las α-hélices y las laminas-beta. Estas formas geométrica a lo largo de la cadena polipeptídica, se denominan estructura secundaria. Estos dos motivos de estructura secundarias a la vez se pliegan sobre si según las interacciones que se establezcan, esta es la estructura terciaria. La estructura terciaria hace referencia a la cadena polipeptídica plegada en el espacio, considerada como un todo. La estructura cuaternaria hace referencia a la disposición espacial de las cadenas polipeptídicas en proteínas formadas por más de una cadena (proteínas multiméricas). Existen claras restricciones respecto a la posibilidad de empaquetamiento de los elementos de estructura secundaria para obtener el empaquetamiento óptimo que permita mantener los residuos hidrofobicos en el “core” de las proteínas, esto hace que se formen los pocos miles de dominios conocidos. Dentro de una proteína, un dominio estructural (dominio) es un elemento que se estabiliza por si mismo y generalmente se pliega independientemente del resto de la proteína. Muchos dominios no son únicos de las proteínas producto de un gen o una familia de genes, sino que aparecen en una gran variedad de proteínas. Los dominios son frecuentemente nombrados según la función biológica en la que intervienen en la proteína donde aparecen predominantemente, por ejemplo, el "calcium-binding domain” de la calmodulina. Aunque es difícil determinar el número de dominios conocidos y varía mucho según las definiciones y la fuente de donde se tome ese dato, según Pfam (Bateman et al. 2004), la base de datos mas completa, basándose solo en información de secuencias, contiene alrededor de 7600 dominios que abarcan el 80 % de las secuencias de genomas completos. Las proteínas están formadas por uno o varios de estos dominios.