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Comunidades de peces muestreados desde agosto 2010 a julio 2013 en dos ambientes lóticos y lénticos del río Paraná en su tramo medio, fueron estudiados a la luz de las variaciones de los pulsos y flujos de inundación. Tres pulsos de inundación se produjeron a lo largo del período de estudio, con diferente magnitud, duración y recurrencia. Durante el invierno de 2012, se produjo un pulso de flujo, siendo la única excepción de aumento del nivel hidrométrico en un período de 366 días de aguas bajas. Un aumento del nivel hidrométrico comenzó en el inicio de 2013, alcanzando su pico máximo en abril (otoño) de dicho año. Las variaciones de las condiciones hidrológicas tuvieron influencia sobre la ictiofauna. La riqueza de especies de peces en ambos hábitats, lénticos y lóticos, se correlacionaron negativamente con los niveles hidrológicos máximos. Ambos tipos de ensambles se estructuraron espacial y temporalmente de acuerdo a las diferentes estrategias reproductivas. Especies migratorias de larga y corta distancia fueron dominantes después del pulso de inundación de mayor intensidad y duración, mientras que las especies sedentarias y de fertilización interna prevalecieron durante los pulsos de flujo y pulsos de inundación de menor intensidad y duración. La similitud del ensamble de peces entre los hábitats fue baja durante los pulsos y flujos de inundación, pero aumentó después de esos eventos en función de su magnitud y duración. Al parecer, los pulsos de flujo también actuarían al igual que los pulsos de inundación como mecanismos de estructuración espacio-temporal de las comunidades de peces.