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Los ensambles de macrófitas del valle de inundación del río Paraná Medio son afectados por características físicas y químicas del agua, morfometría, conectividad y régimen hidrológico. Las fluctuaciones del nivel del agua ejercen una fuerte influencia sobre los ensambles de macrófitas, tal es así que estudios florísticos en diferentes momentos hidrológicos demuestran cambios de la composición, número de especies y biomasa de las macrófitas. En este trabajo analizamos la relación entre la altura hidrométrica y el área de lagunas con la riqueza específica (RE) y la biomasa de macrófitas en 28 ambientes con diferente grado de conectividad. Se registró un total de 110 taxa de macrófitas distribuidas en 38 familias y 75 géneros. Las familias mejor representadas fueron Cyperaceae y Poaceae, en tanto que Polygonum y Cyperus fueron los géneros con mayor número de especies. Considerando ambos períodos hidrológicos, la riqueza media aumentó de 14 taxa en cauces secundarios, a 21 en lagunas conectadas y 22 en lagunas aisladas. Las curvas de especies/área se acercaron a la asíntota tanto para aguas altas como bajas indicando que la RE observada representaría razonablemente bien la RE real de estos ambientes. Adicionalmente, los valores de RE estimados por Chao2 resultaron cercanos a la RE observada para los 4 muestreos sin tener en cuenta el nivel hidrométrico (Chao 2: 120 especies; observada = 110 taxa), en aguas bajas (Chao 2: 100; observada = 87 taxa) y en aguas altas (Chao2: 102; observada= 94 taxa). El número de especies fue afectado por el nivel hidrométrico, pero no por el área de las lagunas (r= 0.16, p= 0.15). Por otro lado, el régimen hidrológico afectó la biomasa de las macrófitas, siendo ésta menor en aguas altas. Entre las especies encontradas, Ludwigia peploides alcanzó el mayor valor de biomasa media (123,6 g m², peso seco) y fue registrada en la mayoría de los ambientes muestreados.