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Los roedores subterráneos del género Ctenomys constituyen un modelo interesante para el estudio de los efectos de la fragmentación del hábitat sobre la estructura genética de poblaciones y especies. El grupo perrensi está formado por tres especies (C. roigi, C. perrensi y C. dorbigny) y poblaciones cuyo estatus taxonómico no ha sido definido. Estas poblaciones se encuentran distribuídas en parches semi aislados en la región de los Esteros del Iberá, un humedal de aproximadamente 14,000 km2, 60% de los cuales se encuentra permanentemente inundado. En este tipo de hábitat, las poblaciones de tuco tucos pueden conectarse o aislarse dependiendo de la extensión de los parches favorables, lo cual está determinado fundamentalmente por el regimen de precipitaciones. Así, el complejo perrensi funciona como una metapoblación, en la cual las distintas subpoblaciones se encuentran en equilibrio entre extinción local y colonización y sufren perídos de conexión a través de migración y perídos de aislamiento en los cuales se encuentran afectadas fundamentalmente por la deriva genética. En este contexto es particularmente dificil establecer los límites entre subpoblaciones, poblaciones y especies, así como su grado de conectividad, actual o histórica. El proyecto propone determinar cuántas unidades evolutivas de Ctenomys están presentes dentro del complejo perrensi, y qué criterios aplicar para establecer los límites de dichas unidades. Resultados previos basados en la caracterización de 16 loci de microsatélites indicaron la presencia de ocho clusters, y la posible existencia de hibridación interespecífica. En este trabajo presentamos resultados preliminares de variación en la región control mitocondrial en cuatro de dichos clusters, ubicados en la zona noroeste de la distribución de estos roedores en el Iberá, al norte del Estero Santa Lucia.