Doctor en Bioquímica
Bioquímica

PROFESIONAL ASISTENTE

Tareas generales dentro de la UE: Durante el próximo período se prevé continuar con las tareas de renovación, mantenimiento y control del cepario del laboratorio. Se debe finalizar el cepario de bacterias pertenecientes al género Rhodococcus y dar inicio al de microorganismos de otros géneros bacterianos disponibles. Se propone realizar un registro con información detallada de cada cepa (origen, características morfológicas, condiciones de crecimiento, etc), y anexar además un registro fotográfico de las mismas. Actividades específicas en el área de Biología Molecular: Como Personal de Apoyo dentro de la UE contribuyo activamente en tareas específicas de diferentes proyectos de investigación. En el marco de todas las líneas resulta de suma importancia establecer no sólo la identidad de las cepas en estudio, sino también su potencial génico, redundancia, contextos y/o arreglos génicos, etc. Para ello, en los casos que sea de interés se realizará la extracción total del genoma, secuenciación, ensamblado, análisis bioinformático detallado para establecer identidad y finalmente su anotación en la base de datos RAST. En otras líneas de investigación en curso, se prevé la puesta a punto en el laboratorio de una metodología para evaluar comunidades microbianas por medio de la generación de genotecas y posterior análisis filogenético. Finalmente, y considerando la reciente incorporación de un equipo QuantGene 9600 dentro de la UE, se gestionará la compra de insumos plásticos y reactivos para el desarrollo de PCR en Tiempo Real, y se trabajará en la adecuación y puesta a punto de la cuantificación relativa de la expresión génica con SYBRGreen. Actividades vinculadas al PUE N° 033: Considerando la capacidad de la cepa V. indigofera EB para producir un compuesto con propiedades anticongelantes y un polímero extracelular con potencial de aplicación para reducir el impacto de las bajas temperaturas en plantas de la región patagónica, se propone participar de un estudio de la interacción planta-bacteria bajo condiciones controladas. Para ello se inocularán hojas de la planta en estudio con la cepa de interés y, posteriormente se realizará la medición de temperatura de nucleación del hielo y de congelamiento extracelular en las hojas inoculadas y en hojas control. Este estudio permitirá definir si la actividad crioprotectora de este compuesto bacteriano es beneficiosa para las plantas y genera de esta manera una mayor resistencia frente a las bajas temperaturas. Conjuntamente, se pretende realizar un análisis exhaustivo de las bases genómicas y proteomicas disponibles para este microorganismo con el objetivo de identificar vías y/o enzimas que puedan estar implicadas directa o indirectamente en la producción de metabolitos de interés biotecnológico o que puedan resultar beneficiosos para la interacción planta-bacterias, tales como: pigmentos, compuestos de reserva, biopolímeros, etc. En el marco del PUE N° 033 y de otros proyectos de investigación en curso, se propone continuar con el estudio molecular de cepas modelo y recombinantes del género Rhodococcus en lo que respecta a su potencial metabólico para la producción de lípidos y otros compuestos de interés biotecnológico. Convenios de trabajo entre la UE y Empresas: Como parte de las actividades del convenio de trabajo entre el INBIOP y la empresa SERMA y con el objetivo de generar inóculos para bioaumentación, se propone participar del aislamiento y caracterización de cepas nativas a partir de muestras de petróleo, suelo y sobrenadante de diferente origen provistas por la empresa. Las cepas bacterianas aisladas se identificarán taxonómicamente a partir de amplificación, secuenciación y análisis bioinformático del gen 16S. A partir de la identificación y en cepas seleccionadas se determinará el perfil de degradación de hidrocarburos en medios líquidos y/o sólidos para hidrocarburos alifáticos, poliaromáticos y mezclas complejas. Además de este convenio, se iniciaron gestiones con la Empresa DIRANSA S.R.L para la firma de un nuevo convenio de trabajo en el que se pretende evaluar la producción de acrilamida en diferentes especies del género Rhodococcus a partir de acrilonitrilo. Se planea participar de las actividades a partir del análisis bioinformático de secuencias genómicas de los microorganismos. Capacitaciones: Se espera acceder a capacitaciones vinculadas a la organización, y monitoreo de colecciones de cultivos; como así también a cursos que me permitan adquirir nuevos conocimientos en el área de Biología Molecular.

SCHOLZ, FABIAN GUSTAVO / INV PRINCIPAL

[INBIOP] INSTITUTO DE BIOCIENCIAS DE LA PATAGONIA -
[CCT CENPAT] CENTRO CIENTIFICO TECNOLOGICO CONICET - CENTRO NACIONAL PATAGONICO -
[CONICET] CONSEJO NACIONAL DE INVESTIGACIONES CIENTIFICAS Y TECNICAS -