DR. OF PHILOSOPHY
LIC. EN GENETICA

PROFESIONAL PRINCIPAL

Algunas líneas de investigación muy avanzadas en el BIOMED podrán verse afectadas o demoradas por algún tiempo, por conocerse en Noviembre 2021 de la necesidad y conveniencia de cambiar de instituto. En Diciembre, se conoció la posible transferencia al CIVETAN, Tandil y luego de reuniones, se consideró un plan de trabajo y objetivos, conociendo posibles líneas de investigación a las que se podría prestar apoyo, asesoramiento y participación. Las enumeramos a continuación, mencionando tareas propuestas, actividades requeridas y nuevos obstáculos analíticos a resolver. Están agrupadas según los temas y laboratorios/grupos de los que se participará en el primer año: laboratorios de Inmunología, de Parasitología y de Virología. Luego se enumeran otras actividades no vinculadas a un laboratorio pero que hacen a una formación profesional continuada y a la mejor inserción en el CIVETAN, la cual comenzará con una pasantía de 2 meses. INMUNOLOGÍA, BRUCELLA: 1) Familiarizarse con la literatura sobre especies de Brucella; 2) Seguir cursos sobre PCR y qPCR; 3) Optimizar técnicas de PCR diagnóstica para detección sensible y especifica de Brucella, en lo posible con sensibilidad aumentada mediante agregado de aditivos químicos especiales que también agilicen el flujo de experimentos. Ensayar las variables que afectan la sensibilidad, robustez y compatibilidad con inhibidores en muestras biológicas. Optimizar parámetros de ciclado para mejorar la detección de secuencias ricas en GC; 4) Revisar con métodos bioinformáticos, incluyendo las bases de datos genómicas, la especificidad y las variables físico-químicas/termodinámicas de los protocolos de PCR; 5) Desarrollar colorantes trackers novedosos para monitorear la electroforesis en agarosa, compatibles con PCR y dando alta reproducibilidad en la migración en el frente de corrida, permitiendo la carga directa de PCRs; 4) Desarrollar marcadores de peso molecular multicolor con colorantes optimizados para cada tamaño de amplímero; 5) Preparar ADN de distintas especies de Brucella en manera rápida y económica; 6) Familiarizarse con las variables técnicas (sensibilidad, rapidez) de distintos métodos de detección de Brucella (cultivo, etc.) y como se comparan a la PCR; 7) Preparar PBMC de animales infectados por Brucella y no, para ser usados en PCR; 8) Revisar/comparar los equipos de imágenes con luz UV; 9) armar protocolos para PCR que prevengan contaminaciones. PARASITOLOGÍA, TRICHINELA: 1) Familiarizarse con la literatura sobre Trichinella; 2) Asesorar en métodos de fotografía de geles y WB buscando sensibilidad con celulares y escáneres comunes; 3) Mejorar métodos de SDS-PAGE y WB; 4) Optimizar electroforesis en geles de 5 cm seguida de WB y de detección colorimétrica de proteínas para ser usadas en serología contra Trichinella con sueros porcinos empleando métodos de revelado cromogénico; 5) Hacer fabricar en Tandil de manera económica componentes de cubas electroforéticas verticales cuyos repuestos no se consiguen, incluyendo vidrios, peines, espaciadores, etc. VIROLOGÍA, HEPATITIS E Y SARSCOV2: 1) Familiarizarse con la literatura sobre el virus de la hepatitis E y en especial con la detección por ELISA de anticuerpos porcinos, 2) Apoyar en técnicas de ELISA y WB; 3) Familiarizarse con el kit COVID AR IgG. OTRAS ACTIVIDADES: a) Familiarizarse con los distintos laboratorios y con los instrumentos a disposición en las distintas técnicas, reunir manuales PDF y si es posible adaptar métodos antes desarrollados sobre cuantificación de proteínas; b) Identificar nuevos colorantes de proteínas visibles pero con fluorescencia UV; c) Intentar aplicar la nueva lámina de sembrado de proteínas, la única que permite spots del mismo diámetro independientemente de la concentración y secuencia proteica; d) Intentar generar nuevo conocimiento en reactivos; e) Seguir la literatura sobre métodos novedosos de ELISA y PCR y sus combinaciones, en formatos de microfluídica o papel o fase sólida; f) Seguir interesándose por el diagnóstico e investigación con ómica espacial (multiómicas resueltas espacialmente por microscopia) siguiendo seminarios y artículos; g) armar una computadora PC propia con procesador i9 12th gen, placa de video, RAM 256, para usar en modelado proteico, bioinformática e introducirse en los siguientes años (en la medida de lo posible) en los campos de la transcriptómica, inteligencia artificial y el deep learning; h) Comenzar un review sobre PTMs de una proteína antes investigada en Italia; i) Asistir a seminarios de la Facultad de Ciencias Veterinarias; j) Continuar con una muy activa y constante divulgación de conocimiento y novedades científicas destacadas, por Linkedin para la red de 7800 seguidores; k) Intentar publicar en congreso; l) generar una amplia biblioteca de libros PDF por áreas analíticas: PCR, ELISA, transcriptómica, etc.; m) interesarse por terapias con PROTACs y CRISPR

ALVAREZ, LUIS IGNACIO / INV PRINCIPAL

[CIVETAN] CENTRO DE INVESTIGACION VETERINARIA DE TANDIL -
[CCT TANDIL] CENTRO CIENTIFICO TECNOLOGICO CONICET - TANDIL -
[CONICET] CONSEJO NACIONAL DE INVESTIGACIONES CIENTIFICAS Y TECNICAS -