Estudio de alfa-sinucleína en solución mediante corrimientos químicos de ¹³C y distancias derivadas de PRE

MARTIN O.A.; VILLEGAS M.E.; VILA J.A.

La Plata.

Congreso; XXXVII Reunión Anual Sociedad Argentina de Biofísica; 2008

Sociedad Argentina de Biofísica

Las proteínas intrínsecamente desestructuradas (IUP), carecen de estructura terciaria definida, y debido a su flexibilidad es difícil obtener suficiente cantidad de vínculos derivados de NOEs o cristalizarlas. Sin embargo recientemente se ha podido determinar la estructura de algunas IUP en solución mediante la técnica de NMR conocida como Paramagnetic Relaxation Enhancement (PRE) Por otro lado, recientemente se presentó un nuevo método que permite determinar, validar y refinar la estructura de proteínas utilizando solo vínculos de distancias derivados de NOEs y corrimientos químicos de 13C(alfa) (que proveen información para todos los ángulos torsionales y para todos los residuos) sin necesidad de usar ninguna otra información experimental. La base de este método es el computo de los corrimientos químicos de los 13C(alfa), a nivel de la Teoría del Funcional de la Densidad (DFT), y la comparación de estos valores teóricos con los datos experimentales. En este trabajo adaptamos esta metodología para usar vínculos derivados de PRE en vez de distancias derivadas de NOEs. Aplicándolo a la IUP a-sinucleína, con dos objetivos I) Validar modelos obtenidos previamente por métodos tradicionales. II) Generar nuevos modelos utilizando información de 13C(alfa) y distancias derivadas de PRE. Para simplificar el análisis del ensamble heterogéneo obtenido se recurrió al método conocido como Principal Component Analysys