IBR   13079
INSTITUTO DE BIOLOGIA MOLECULAR Y CELULAR DE ROSARIO
Unidad Ejecutora - UE
congresos y reuniones científicas
Título:
Análisis genómico comparativo de cepas clínicas multirresistentes epidemiológica y filogenéticamente relacionadas de Acinetobacter baumannii.
Autor/es:
MORÁN-BARRIO, JORGELINA; VIALE, ALEJANDRO M.; CAMERANESI, MA. MARCELA; GALLINA NIZZO, GABRIEL; LIMANSKY, ADRIANA S.
Lugar:
Rosario
Reunión:
Congreso; XXIII CONGRESO LATINOAMERICANO DE MICROBIOLOGÍA, XIV CONGRESO ARGENTINO DE MICROBIOLOGIA, IV CONGRESO LATINOAMERICANO DE MICROBIOLOGIA DE MEDICAMENTOS ? CLAMME REUNIÓN DE LA SOCIEDAD LATINOAMERICANA DE TUBERCULOSIS Y OTRAS MICOBACTERIOSIS (SLAMTB); 2016
Institución organizadora:
Asociación Latinoamericana de Microbiología (ALAM)
Resumen:
Acinetobacter baumannii presenta elevada capacidad de adquirir nuevos determinantes genéticos, característica que incide en la evolución de este patógeno oportunista hacia el éxito clínico. En este contexto, el análisis comparativo de genomas de cepas clínicas multi-resistentes (MR) contribuye a una mayor comprensión de los elementos genéticos móviles (EGM) involucrados en la adquisición de resistencia, como así también revela los eventos genéticos implicados en la transferencia horizontal de genes de resistencia. Así, estudios genómicos de Acinetobacter baumannii proveen una visión expandida de la capacidad de adaptación de esta especie bacteriana en el hábitat nosocomial. El objetivo del trabajo es evaluar comparativamente los genomas completos de cepas clínicas MR de A. baumannii relacionadas clonalmente, con especial énfasis en su genoma accesorio.Los cromosomas de las cepas MR Ab242 resistente a carbapenemes (carbR) y Ab244 sensible a carbapenemes (carbS) fueron inicialmente alineados con 31 genomas de A. baumannii, obtenidos de la base de datos del NCBI (Mauve). La matriz de distancia obtenida de los 33 genomas de A. baumannii fue usada para el análisis filogenético empleando ?Neighbor-Joining?. Los genomas ordenados de ambas cepas fueron estudiados en forma comparativa con especial énfasis en la búsqueda de regiones diferentes involucradas en la organización del genoma accesorio (ACT Artemis, CGview server). La localización e identidad de los EGM se llevó a cabo mediante ensayos de transferencia de ADN, y PCR/secuenciación. El análisis filogenético mostró que las cepas en estudio pertenecen a un clado alejado de los clones internacionales I y II, indicando así un origen común para ambas cepas ST104 que difiere de los clones mayoritariamente circulantes al presente. El alineamiento de los genomas completos de Ab242 y Ab244 arrojó un 99% de identidad nucleotídica indicando un alto grado de conservación entre ambos. Sin embargo, se identificaron regiones diferentes en sus genomas accesorios, incluyendo islas tipo-AbaR y de resistencia a metales pesados, profagos y plásmidos. El análisis in silico del contenido plasmídico reveló la presencia de plásmidos de diferentes tamaños (25 kpb, 12 kpb y 9 kpb) para Ab242 carbR siendo el primero portador del gen blaOXA-58 el cual confiere resistencia a carbapenemes. Se identificaron formas multiméricas de estos plásmidos, evidenciando eventos de recombinación a través de sus sitios Xer y un equilibrio dinámico entre ellos. Un plásmido de 7 kpb presente en Ab244 carbS mostró completa identidad con el de 9 kpb de Ab242 carbR revelando la deleción de una región flanqueada por sitios Xer (2 kpb).Estos resultados ponen de relevancia la plasticidad del genoma accesorio de cepas relacionadas de A. baumannii, y proveen así una mayor comprensión de la evolución de los determinantes de resistencia en la población de patógenos nosocomiales